柑桔黑斑病在高温多湿的条件下，发病严重。闷热不通风的果园发病尤为严重。病菌的发育最适温度为25摄氏度，气象条件对病菌的形成影响很大，在温度27－28摄氏度，脱落的病叶片，如在时干时湿的条件下，在10－27天内就会产生大量病菌，若天气长期潮湿，病叶会过早腐烂而导致病菌死亡。
病害一般在春梢发生较少，而在夏秋梢发生较多。4、5龄幼树的果实发病少，而7龄以上的大树发病多，特别是老树发病较重。
凡栽培管理粗放，肥料不足，土壤有机质缺乏，树势衰弱的果园发病较重。地势较低，排水不好，相对湿度大的果园，病害也较严重。
品种间的感病程度有一定的差异，一般柑类如大红柑（茶枝柑）。（Peng）柑、蕉柑等较感病，桔类次之，橙类发病较少。在广东则以大红柑、年桔受害最为严重。此外，柠檬、沙田柚发病也较重。
贮藏运输期间，病害发生严重程度与采摘包装过程中造成的伤口有密切关系，伤口越多，发病就越重。
防治黑斑病应采取在清洁田园，加强栽培管理的基础上，重点搞好喷药保果的综合防治措施。
1、喷药保护由于该病只在幼果期进行侵染，所以喷药保果必须在落花后一个半月内进行。在此期间应每隔15天左右喷一次药。药剂可用50%多菌灵可湿性粉剂800倍液，50%托布津可湿性粉剂500倍液，75%百菌清可湿性粉剂500－800倍液，65%代森锌可湿性粉剂500倍液，50%退菌特可湿性粉剂500倍液或用0.5%波尔多液。
2、清洁田园因病菌主要来自落在地面的病叶、病果和病枝，结合修剪，剪除病枝，并将落叶、落果收集干净，加以烧毁，并喷施一次0.5度波美的石硫合剂，以减少病菌来源。
3、加强栽培管理树势衰弱易得此病。因此要加强水肥管理，促使树势生长健壮，提高抗病力，对于感病品种和老年树尤为必要。此外，在采收及贮运时尽量不要损伤果皮，以免在贮运期间增加此病的发展为害。
