近几年来，广大棉区采用包衣精加工棉种的农户越来越多，包衣棉种应用的面积不断扩大，有些植棉乡镇包衣棉种的占有率几乎达100%。包衣棉种具有省种、早发、出苗率高、抗逆性强等诸多优势，深受广大农民的欢迎。
但是，在棉花营养钵育苗移栽的过程中，也存在一个带有共性的问题，就是有些地方或者有的农户，同样采用包衣棉种，棉花出苗率高达90%以上，但成苗率并不理想，有的只达70%左右。从调查的原因看，一是有些农民对包衣棉种的认识有误解，认为用了包衣棉种，苗床可以不再消毒防病，思想上麻痹大意；二是有的棉种播后盖土过浅，棉花带壳出苗，弱苗遇干旱或阴雨很快死掉；三是营养钵摆钵过稀，钵间缝隙未填满土，棉苗失水很快，也易死去一部分苗子；四是对苗床膜内温度、湿度调控不当，也易死苗。综合分析，一类属于病害死苗，另一类属于生理死苗。
为了更好地提高包衣棉种的出苗率和棉苗素质，在营养钵育苗及苗床管理上，更要严格地采用相应防范配套技术。
要彻底阻止棉花苗病的侵染棉花苗期病害多为立枯病、炭疽病，兼有角斑病、轮绞斑病等。它们的主要传播途径，一是棉种带菌，二是土壤带菌，三是育苗的工具带菌。因此，除棉种已进行了处理外，还要对钵土、盖钵土以及拱架、旧农膜等进行消毒。一般用多菌灵喷洒消毒，其浓度为1∶200倍，亦可用甲基托布津等进行消毒，均能收到良好的预防效果。
要摆好钵盖好土营养钵要摆成梅花形，钵缝间要填满细土。棉种播后要及时覆盖细土或沙土，厚度为1厘米左右。
要对棉苗护叶保根棉苗两片子叶平展之后，由于幼茎尚未木质化，最易遭受病害。为了预防病菌侵染，要及时喷洒波尔多液保护棉苗。其配制是：用1公斤硫酸铜，0.5公斤生石灰，各对清水50公斤化解，然后混合搅拌而成。亦可喷施0.1%~0.2%的三唑铜（粉锈宁）溶液，效果也很显著。
要调控好苗床温度在高温多雨的环境条件下，即使生长整齐的棉苗，也极易发生线苗，致使素质下降，抗性减弱。如调控不及时棉苗就会感病。因此，要提倡短床育苗，苗床长度以10米为宜，以确保棉苗稳健生长。
为此，凡是采用精加工棉种育苗的地方，都应采取综合防范措施，以便更好地发挥精加工棉种的抗灾功能
