水稻条纹叶枯病典型症状是：苗期发病心叶基部出现褪绿黄白斑，后扩展成与叶脉平行的黄色条纹，条纹间仍保持绿色。不同品种表现不一，糯、粳稻和高秆籼稻心叶黄白、柔软、卷曲下垂、成枯心状。矮秆籼稻不呈枯心状，出现黄绿相间条纹，分蘖减少，病株提早枯死；分蘖期发病的先在心叶下一叶基部出现褪绿黄斑，后扩展形成不规则黄白色条斑，老叶不显病；拔节后发病的仅在剑叶下部出现黄绿色条纹，抽穗畸形，结实减少。由此可见，发病越早，病情越严重，损失也越大。
防治上需要特别提示两点：一是由于病毒只能由灰飞虱传播，所以“治虫防病”、“切断毒源”是防治的基本方针。针对一、二、三代灰飞虱成虫迁入秧田和本田并形成三个发病高峰的特点，要分阶段进行多次防治才能奏效；二是根据病毒侵染越早、病情越重的规律，采取“治秧田保大田，治前期保后期”的防治策略。
药剂防治一般在6月中旬开始，重点抓好秧苗期灰飞虱的防治，推荐使用的药剂为：吡虫磷（大功臣）吡蚜酮、氟虫腈、毒死蜱、锐劲特或它们的混合制剂。
大田喷雾防治要抓紧水稻返青分蘖期进行，可选用的药剂有：吡虫啉、毒死蜱（长效缓释剂）、氟虫腈（锐劲特）、异丙威（叶蝉散）以及噻虫嗪、噻嗪酮、阿维菌素等。建议轮换用药以延缓灰飞虱产生抗药性；选择持效性较好的吡蚜酮、氟虫腈、噻虫嗪、吡虫啉等与速效性较好的毒死蜱、异丙威、混灭威、敌敌畏等混用，以提高防治效果。
此外也可采用吡虫啉、氟虫腈（锐劲特）拌种，发病初期可喷洒氯溴异氰尿酸（消菌灵、灭菌成）宁南霉素（菌克毒克），有抑制病毒，减轻症状的作用。
另外，耕翻灌水，清除田间和田边、沟边、路边的杂草，集中育秧并远离小麦和玉米田，可减少病毒来源；适当推迟播期，种植抗耐病品种，增施磷、钾肥，加强管理也是必要的综合防治措施。
