在预防方法上要注意如下六点：
一是要改进育秧方式。因地制宜采用旱育秧稀植技术，或温室蒸气催芽育秧，或薄膜覆盖。
二是要精选种子。选成熟度好，纯度高且干净的种子，浸种前要晒好种。
三是浸种要浸透。以胚部膨大突起，谷壳呈半透明状。催芽要做到“高温（36-38℃露白，适温（28-32℃）催根，淋水长芽，低温炼苗。”也可施用ABT4号生根粉，使用浓度为13mg/公斤，南方稻区浸种2小时，北方稻区浸种8-10小时，捞出后用清水冲芽即可，也可在移某前3-5天，对秧苗进行喷雾，浓度同上。对水稻立枯病防效优异。
四是要提高播种质量。根据品种特性，确定播期播种量和苗龄。日平均温度稳定通过12℃时方播于露地秧，均匀播种，根据天气预报后有3-5个晴天，有利谷芽转青来调整浸种催芽时间。播种以谷陷半粒为宜，播后撒草木灰保温，有利扎根竖芽。
五是加强肥水管理。芽期以扎根立苗为主，保持畦面湿润，不能过早上水，遇霜冻时暂时灌水护芽。一叶展开后可适当灌浅，2-3叶期灌水以减小温差，保温防冻。寒潮来临要灌“拦腰水”护苗，冷空气过后转为正常管理。
六是药剂防治。一旦发生烂秧可选用95％绿亨一号（恶霉灵）精品4500倍，或25％甲霜灵可湿性粉剂800倍液，或65％敌克松700倍液。如果发生立枯病、绵腐病，可首选40％灭枯散可湿粉剂或30Y立枯灵500倍液。提倡喷洒壮丰安水稻专用型植物生长调节剂或植物动力2003，能有效地防治病害，使秧苗恢复生机。
