玉米秸秆还田方法很多，有生物菌堆沤、机械切碎直接还田、垫圈过腹、沼气发酵等效果都很好。但从经济效益、社会效益、生态效益分析，生物菌堆沤秸秆效果最佳。
所谓生物菌堆沤秸秆，就是把玉米秸秆拉到田间地头或闲地铡碎，把菌剂、化肥放在秸秆上喷上足够的水，用塑料薄膜或泥覆盖严密即可。该技术的优点：一是秋收种麦期间正是农事繁忙季节，其他方法费时费工难度较大，而采取生物菌堆沤简化了还田程序，省工省力。二是提高了还田质量和效果。堆沤每亩秸秆的费用仅为14-20元，而生物菌堆沤产生的有机肥含量高达70．9％，是普通农家肥的3倍。1亩秸秆通过堆沤产生的肥效相当于17公斤标准氮肥，12公斤标准磷肥，20公斤标准钾肥的总和，经济价值达百元以上。该肥入土后能有效地改良土地理化性状。当季就能使土壤有机质增加，降低土壤容重，增加土壤的空隙度，减轻作物病害，促进作物早熟，改善农产品的品质。同时还可以避免秸秆直接还田影响整地质量和深耕细作的弊病。总之是一项前景广阔的新技术。
用生物菌堆沤玉米秸秆主要技术要点是：
1、材料准备。堆制1000公斤秸秆用1公斤生物菌，尿素5公斤，玉米秸粉碎成15厘米。
2、首先把秸秆充分湿透，用0．1％菌剂均匀喷洒在湿透的秸秆上，再撒入0．5％尿素，注意使菌剂和 尿素在秸秆上分布均匀。再把秸秆堆成堆，堆宽2米，高1．5-2米。分三层堆积。一、二层厚50-60厘米，第三层厚30-40厘米。分别在各层间撒菌剂和尿素，用量比4∶4∶2。
3、把秸秆堆制成堆后，立即就地取泥封堆，堆顶呈盘状（或用黑塑料布盖住），肥堆两边与地表呈70-80度的角。
按操作规程堆制后，30天即可成腐熟高效的优质有机肥。
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