导致棉花早衰的原因有：因病导致的早衰棉花病害以黄枯萎病危害最普遍、最重。发病与温度关系密切，枯萎病在苗期地温20℃左右时开始出现病状，25℃~30℃时病情受抑制。黄萎病发病温度较枯萎病高，所以发病高峰较枯萎病晚，气温25℃时发病率高，28℃以上时病情缓解，这一时期，如果降雨多，田间湿度大，病情将迅速蔓延。一般每年7~8月份发生普遍。
营养失衡导致的早衰随着机械化程度的提高和农村耕作习惯的改变，“卫生田”大量出现，忽视有机肥，只靠施用化肥，从而导致土壤营养失衡，土地后劲不足，抗灾能力明显下降。
生育期载负过重导致的早衰棉花开花现蕾以后，营养生长与生殖生长并进。结铃过多，导致生理负荷重，营养跟不上，植株抗性降低。而这一时期又正是黄枯萎病高发期。从而导致早衰。
耕作栽培导致的早衰由于产棉区大面积种植棉花，导致轮作困难，重茬现象严重。在地势低、排水不良的地块，棉花根系发育不良，抗生菌数量较少，病菌积累严重，从而导致早衰。
防治棉花早衰要从以下几个方面入手：选用抗病品种选种时要选用经有关机构审定的多抗品种，严禁从重病区调入未经检疫合格的种子，种子最好要脱绒包衣处理。
合理轮作与深耕棉花最喜生茬种植。间隔4~5年内未种植过棉花的田块，可通过深耕，改善土壤结构，促进植株健壮生长，防治早衰。
加强田间管理棉田采用间歇式灌溉是最佳灌溉方式，这样可以增强土壤透气性，改善根际环境，这样有利于微生物、抗生菌生长。灌溉以后，土壤易板结，这时要结合中耕培土。种植前最好把有机肥施足，生长期间补充化肥。一般增施磷钾肥，稳施氮肥。前期氮肥施用过大，容易导致旺长和坐桃不稳。由于磷在土壤中流动性差，加之利用率低下，因此，磷肥施用对防治棉花早衰也极其重要，如果底肥施用磷酸二铵，那么棉花整个生育期状况将明显改善。含腐殖酸的化肥种植、追施时也应优先选择。另外，加施硼锌、微肥，中后期叶面喷施磷酸二氢钾，对防治棉花早衰，都有很好的效果。
药剂调控对于病虫害要适时防治，控制蔓延。发现病株及时处理。针对棉花的各个生育期要适时化学调控，使植株向着健壮、高产方向发展。
