随着种植业结构的大规模调整，我国部分地区单季稻面积大量上升。由于单季稻生长季节长，条件适合多种病虫为害，因此，单季稻的病虫比双季稻要严重。目前对水稻生产构成威胁的中后期主要病虫，仍以水稻螟虫(以二化螟为主)、稻纵卷叶螟、稻飞虱、纹枯病、白叶枯病和细菌性条斑病、稻瘟病、稻曲病，以及杂交稻后期综合症等。根据近年各地防治水稻病虫害的经验，要有效地控制病虫为害，保证水稻丰收和生产出安全稻米，对水稻中后期主要害虫采取以下防治措施。
水稻螟虫(主要是二化螟) 是水稻的主要害虫，近年来在部分省份发生较重。由于多年来连续使用单一药剂防治，使二化螟对杀虫双、杀虫单产生高度抗药性，部分地区二化螟对三唑磷也产生高度抗药性。因此，在这些地区已不宜使用杀虫单或杀虫双防治二化螟，或单独使用三唑磷防治二化螟。对于二化螟的防治应根据当地病虫测报站发布的病虫情报，对稻田进行虫情调查，当分蘖期孵化高峰后5-7天，每亩有枯鞘团100个或枯鞘率1%-15%；或当破口期，株害率达0.1%时，应进行药剂防治防治。可选用下列任何一种药剂进行防治，使用技术如下：
(1)5%锐劲特SC是目前防治二化螟效果最佳的农药，每亩用量30-40毫升，在二化螟2-3龄高峰期使用，除特大发生外，用一次药即可；
(2)40%稻康(三唑磷)乳油，每亩50毫升，在二化螟1-2龄高峰期使用，发生严重时5-7天后再用药一次；
(3)30%扑虫特乳油，每亩35-40毫升，在二化螟1-2龄高峰期使用，发生严重时5-7天后再用药一次。
(4)20%三·阿乳油，亩用50-60毫升，在二化螟1-2龄高峰期用药，发生严重时5-7天后再用药一次。该药应下午3-4时以后施药。
(5)50%稻螟清(唑·敌)乳油，亩用80-100毫升，在二化螟1-2龄高峰期用药，发生严重时5-7天后再用药一次。
(6)18%虫杀手(杀虫胺)水剂，亩用350-400毫升，在二化螟卵孵化盛期用药，发生严重时过5-7天再用药一次。
(7)78%精虫杀手(杀虫胺)可溶性粉剂，亩用50-60克，在二化螟卵孵化盛期用药，发生严重时过5-7天再用药一次。
上述药剂加水40-50公斤喷雾，同时必须保持田间有3-5厘米水层以保证防治效果的发挥。使用三唑磷系列农药防治螟虫，需注意对稻田稻飞虱的监测，因该药有刺激稻飞虱产卵作用。
稻纵卷叶螟 近年来在部分地区发生较重，因田间发蛾峰多、发生量大、地区间和田块间差异大，以及低龄幼虫为害不易被人们发现等原因，经常出现大面积稻叶被纵卷叶螟刮白现象。由于目前使用的防治稻纵卷叶螟的农药对于防治适期要求较严，若错过最佳防治适期，则会影响防治效果，增加防治成本。因此广大农户应在6月下旬至9月底，稻纵卷叶螟的主要为害期，密切注意当地测报站的病虫情报，根据预报在纵卷叶螟的卵孵高峰期每亩使用80%杀虫单或78%虫杀手可溶性粉剂50-60克，或18%杀虫双或18%虫杀手水剂300-400毫升(上述药剂防治成本较低)；也可在卵孵高峰后1-2天(即1龄幼虫高峰期，稻田中水稻第一叶叶尖大量出现卷叶时)每亩用48%乐斯本乳油60毫升，或40%新农宝乳油60毫升，或40%毒死蜱乳油60毫升，或35%纵卷清(乙酰甲·毒)可湿性粉剂80克，或17%世纪乐(阿维·毒)乳油80-100毫升，30%乙酰甲胺磷乳油175-200毫升，5%税劲特SC45-50毫升，加水30-45公斤细喷雾。当虫量发生较大，或世代重叠严重，一次尚不能有效控制稻纵卷叶螟为害时，过5-7天再用药一次。
稻飞虱 在部分地区造成大面积为害的水稻害虫主要是褐稻虱和白背稻虱，如失治可造成大面积毁杆倒伏。化学防治是目前控制稻飞虱的主要方法。可根据当地病虫情报预报的适期，结合田间调查，当每百丛有稻飞虱1000-1500只，且以低龄若虫为主时，每亩用25%扑虱灵可湿性粉剂(该药对高龄若虫效果不好，但防治成本氏)30-40克；若以高龄若虫或成虫为主时，可选用吡虫啉系列，如每亩用10%大功臣可湿性粉剂20-30克，或10%施可净可湿性粉剂20-30克，或10%一遍净可湿性粉剂20-30克，或10%蚜虱净可湿性粉剂20-30克，或5%利虫净乳油20-40毫升加水45-50公斤喷雾防治。在水稻黑条矮缩病发生地区，宜采用吡虫啉防治稻飞虱。一般年份早、连作晚稻只需用上述药剂防治1-2次，单季稻防治2-3次。在大发生年份可根据当地农业部门提供的病虫情报进行防治。
