这一阶段，由于菌丝大量的增殖，不仅菌丝量大，而且又贮存了丰富的营养，此时菌丝已进入生理成熟期，如继续给以恒定温度、充足水分及新鲜空气，菌丝将会保持活跃的生长状态，难以进入子实体这个阶段。因此，在菌丝生理成熟时，应有计划地进行低温诱导，造成干湿、冷热的落差，迫使菌丝相互交织扭结成盘状组织，周围菌丝不断给盘状组织输送水分和养料，使盘状组织膨大成为子实体原基，由原基发展成菇蕾。
香菇是低温变温结实性的菇类，应视品种控制好变温时机。以7402为例，当压块经15～18天的培养后，菌块表面转色良好，此时改变条件控制菌丝从营养生长转入生殖生长阶段。其措施一是制造较大的昼夜温差；二是采用减少通风换气如前期日平均气温在15℃以下，昼夜温差在10℃以上，则达到香菇子实体的最适温度，此时可停止换气3天。而后，白天保持室内温度20℃以下，晚上打开门窗及活络天窗，扩大昼夜温差，其温差必须在8℃以上。必要时连续进行数次，还可采取夜间12点以后掀开覆盖薄膜，以拉大昼夜温差和干湿的显著落差，就可顺利形成菇蕾。在塑料大棚内，白天棚内温度可达20℃左右，晚上降至4～5℃，有时栽培块稍有结冰。菌丝在这种较大温差及较强散射光线刺激下，连续5～6天，就能大批形成原基，长成健壮的菇蕾。待菇蕾长到蚕豆大小时，把栽培块搬回菇房，让其长大，有条件的也可用暖气催蕾，让其出菇。
原基形成后，一般只有3～6天的生命力。每形成一次原基，就要消耗大量养分；多次原基发生如不能长成菇蕾，就会造成减产。所以有效地控制第一批菇蕾的形成是高产的关键。首先应控制好形成原基的条件和时间，掌握好翻转栽培块的“火候”。因正常情况下订架上先是反面形成菇蕾，因此一定要等到大多数菇蕾长到黄豆大小时，才能把栽培块反转过来；也可揭去薄膜，用喷水保湿方法促进菇蕾长大。另一方法，在气温符合出菇要求的条件下，可采用提前翻块，揭去覆盖膜数天至菌块表面干燥不粘手，再将薄膜盖上，而后停止换气，同时拉大昼夜温差，也能使第一茬菇整齐出好，特别是在菌龄短时压块，采用此法反而可提前出菇。另外，因持续高温或其他原因，造成压块30余天后，栽培块反而迟迟不能形成菇蕾，可采取先翻块，进行正常的通风换气的管理，待气温下降后立即拉大温差与干湿差进行刺激，也可出好菇。
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