恶性杂萆适应性广，繁殖力强，能很快蔓延成优势种群；且大多为多年生杂草，根茎发达，难以防除。因此，对于这些杂萆的防除，建议采用下列措施：
农业及机械防除。农业防除的措施有轮作、施用腐熟的厩肥、合理密植、深耕等措施综合运用。物理或机械防除，是在外来生物开花结果期前，用割草机割去杂草地上部分、减少种子量。
人工防除。人工防除适宜于那些刚刚传入、定居，还没有大面积扩散的入侵物种。人工防除可在短时间内迅速清除有害生物，但对于已沉入水里和土壤的植物种子和一些有害动物则无能为力；高繁殖力的有害植物容易再次生长蔓延，所以需要年年防除。
生物防除。即在有害生物的传入地，通过引入原产地的天敌因子重新建立有害生物与天敌之间的相互调节、相互制约机制，恢复和保持这种生态平衡。因此生物防除可以取得利用生物多样性保护生物多样性的结果。
替代控制。即用有经济或生态价值的本地植物取代外来入侵植物。
变废为宝。恶性杂草，特别是有毒杂草，体内具有一些特别物质或具竞争力的物质。研究和利用这些物质，可作为植物源农药，或进一步研究作为新的先导化合物发展新的杀虫剂、杀菌剂、除草剂。据报道，从紫茎泽兰提取的物质制成染料，不仅色彩鲜艳，而且可以防虫蛀。蔓泽兰是一种中草药，可治肺炎、肺热咳嗽、支气管炎、感冒，水肿、脑中风等。
化学防除。化学除草剂是控制恶性杂草最有效的武器已成为不争的事实。因为一是可以快速取得效果；二是使用者避免与毒草长时间直接接触，有效地保护使用者的安全；三是在较短时间内，达到控制害草，修复生态的目的。因此，化学防除具有显著的经济效益、社会效益和环境生态效益。乱用或滥用除草剂会造成药害、带来环境污染等问题。因此科学使用除草剂极为重要。
总之，可以说对于大多数外来恶性杂草，都能研发出针对性的高效、安全、低污染的化学防除方法。在外来有害杂草的防除中，应根据当地的生态条件，采用检疫等法律手段控制其传播和蔓延，采用农业、生物、物理、化学等综合措施，控制有害杂草的危害，迫使害草种群退化，建立有益植物群落，从而达到生态修复，长久控制害草的目标。
