百合采挖和收藏过程中，由于暴露在太日光下时间太久，百合鳞片颜色由白色变为褐色，此类状况被称为褐变。褐变是在百合鳞片中的生物酶催化作用下产生的氧化反应。褐变下降商品百合的品质，如是百合种，褐变后的种球发芽率低，导致烂种。今年百合成熟早，估计在7月上旬前后采挖，因此，要堤防早防褐变。
采挖时.要小心遮光覆盖。在强太日光直射下，从土壤挖出来的百合常易出现褐变，而这常常被栽培户所忽视，从而下降了百合质量。因此采挖最好在阴天或晴天下午，挖出来的百合也不能在露天暴露太久。如在晴天上午采挖，挖出来的百合要小心准时用稻草等覆盖物覆盖遮光，避免直接暴露在强太日光下而形成氧化褐变。准时去掉泥土和杂物，剪除根系，放入箩筐。放满后箩筐上也要放覆盖物遮光。采挖后准时运回，摆放室内阴凉处，摊开稍晾干，不要放在室外曝晒。
商品百合及早烫片。烫片的目的是杀死百合中促进褐变的生物酶，避免酶促褐变，杀死病菌，避免腐烂。有些农产不了解烫片的原理与作用，常常不能准时烫片。由于烫片较迟，以致于在烫片前边片甚至心片形成了褐变或开始出现褐变，加工后干片色泽不白，成为黄片甚至黑片。因此，采挖后的百合要尽早选择晴天烫片。烫片的时间过长易碎烂，烫片时间过短，生物酶未被完全杀死钝化，以致于出现更严重的褐变，最终变为黑片，严重影响品质。在新邵，农民常用荷叶锅烫片，荷叶锅盛水50千克，烧沸，将洗净沥干的鳞片15千克左右倒入其中，边倒边用棍棒搅拌。百合由白色稍转黄、由黄色转变成白色时用指甲刮片子皮起粉状，用口尝片子生脆，折断片子断面没有白心，锅中水也未变糊，说明烫制时间适宜，立刻出锅。一般来说，边片在锅中待沸水翻滚5―6分钟，心片待沸水翻滚2―3分钟即可立刻出锅。每锅水烫2―3次片子就要换水。出锅后立刻冷却、晒干。
百合种贮藏。为了避免褐变腐烂，贮藏处要干燥、通气、阴凉、遮光。一般采用沙土层积法遮光。收挖后将百合鳞茎放在阴凉的室内稍摊晾，下降鳞片中水分，但时间不宜长，一般2天左右。选择一问阴凉的房子，用0.3％甲醛液或0.3％高锰酸钾液喷施地表，后在地表上铺一层厚5―7厘米的清洁园土或河沙，将百合放置其上，布列整齐。再在百合上覆盖一层厚约3―4厘米的土或沙，如此重复，高度不要超过1.5米，四周用土或沙封严。这样 保证了遮光、保水、透气。每隔20―30天检查一次，不宜过量翻动。如发现坏变的种球，应准时清除。
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