修剪是制作银杏树盆景的主要技术之一。目的在于突出主干，充实观赏枝，表达各种不同意境，提高艺术价值，使其自然古朴、清秀淡雅。原则是剪去多余的侧枝、平行枝、交叉枝、过密枝、徒长枝和病枯枝。
修剪的基本手法有三，即短剪、疏剪和缩剪。短剪即将枝条剪短，刺激剪口下的侧芽萌发，形成较强的侧枝，同时有丛生倾向，便于造型，剪后常萌发二次芽，增加分枝级数。对主干进行修剪，是为了控制树体高度，促使侧枝发育。对侧枝进行短剪，是为了促使隐芽萌发。疏剪即将枝条从基部剪去。
主要对象是枯死枝、病虫枝以及不适宜造型的多余枝和过密枝，使留下的枝条得到充足的养分，生长健壮。缩剪即将枝条一部分剪去。可使根蘖苗或实生苗株体缩小，有利成活；也可促使萌发新枝，使衰老的桩头恢复树势。
修剪目的在于突出主干，充实观赏枝，提高艺术价值。修剪的原则是剪去多余的侧枝、平行枝、交叉枝、过密枝、徒长枝、病枯枝。
第一年是培养桩头的基础。夏季强旺枝生长快，可在两个分枝上缩剪。修剪刺激后所生出的二次枝，要及时剪除。夏末秋初生出的新枝，可予保留。冬季落叶后和第二年发芽前，对轮生枝、交叉枝、过长枝等多余枝条应一律剪除。对桩木根部生长的萌蘖条要及时剪除。
第二年是缠扎铁丝和劈干造疤。缠扎时要防止枝与干生产断裂撕开现象，若主干基部比较坚硬，造型拿弯时应用麻绳、塑料带从主干基部螺旋式缠扎，以防弯曲中发生撕裂。也可用斧头砍开主干的中下部，深达髓部，这样更能增加盆景的峻峭雄奇之感。
第三年时，干粗、株高、冠大、根深，须更换大盆，填足肥沃土壤，同时，搞好做顶工艺。其方法是：顺着主干打一个边圆形的圈，后将侧枝分别向四周分散。
第四年枝条逐渐增多，株形趋于稳定，即可定于作品盆中，然后进一步加工整形，根据原设计方案，做出千姿百态，神采各异的盆景
