旱苗 今年随小麦收获推迟，玉米播种也紧接着推迟，播种后没有下雨，尽管底墒好，但由于玉米小苗小，根系浅，水分供应不足酿成旱黄苗。对于发生此类玉米黄苗的地块要浇小水，利于玉米苗根系下扎。
锄草剂利用不合理 一些农民在应用锄草剂时，不仔细阅读说明书，形成了利用对策不妥———随意加大用药量；盲目与另外农药混用；机收麦田，麦茬高“惜水不惜药”；农户间相互借用喷雾器；把另外农作物剩余的锄草剂拿来利用（把小麦田的锄草剂作为玉米田来用），结果酿成药害发生黄苗，甚至死苗。对于此类玉米黄苗，应对症施治，加大浇水量，缓解药害症状，也可补种部分杂粮作物。
病害 重要是苗枯病。苗枯病多在二、三叶期开始发病，病苗叶子发黄，边缘焦枯、叶子由下向上逐渐发黄干枯；拔出小苗观察，根系不良，根毛减少，根系变褐。轻病者出现黄苗弱苗，重病者逐渐死亡。发病初期用恶霉灵＋叶面肥（绿风95、爱多收、壮苗灵等）喷施玉米基部，顺根入土，成效显著。
虫害 玉米苗期虫害重要有棉铃虫、粘虫、金针虫、蚜虫、蓟马、瑞典秆蝇、地老虎等。一般容易发现，也较容易防治和治疗。再者是玉米耕葵粉蚧，当玉米出苗后，以若虫和雌成虫集中在玉米小苗近地面的茎基部、根部和叶鞘内，汲取汁液密集为害，受害玉米叶鞘首先发黄干枯，玉米茎基部发黑，根尖变黑腐烂，酿成玉米成长缓慢，严重时难以结实，酿成整株死亡。防治和治疗措施：采用轮换倒茬。玉米耕葵粉蚧只为害禾本科植物，故能够采用轮栽或倒茬，将受害较重的夏玉米地块改种其他双子叶植物。用40%辛硫磷乳油等内吸性杀虫剂500~1000倍液稀释后喷施在玉米小苗基部或灌根。
生理缺素症缺锌 玉米为锌敏感作物，缺锌易产生白花苗，严重缺锌时停止成长甚至幼芽死亡。施锌以锌肥基施成效最好，若成长期发现缺锌后，采用追施：每1/15公顷用1-2公斤硫酸锌拌细土10-15公斤，在苗期至拔节期条施或穴施；或喷施：用0.1%硫酸锌溶液在苗期至拔节期间断喷两次，每次间隔7天，每1/15公顷喷液量为50-75公斤，浓度超过0.4%时，会发生肥害。
