青花菜的生理性障碍有多种，生产中易出现的有以下几种：
1、生理性黑斑病
症状及发生原因：主要表现在青花菜的花梗及小花薹上的黑斑现象。许多中晚熟品种较易感病，主要原因是土壤中缺乏能被青花菜吸收利用的钙、硼离子，并跟施肥水平、土壤干燥等因子有关。
克服技术：（1）合理施肥：严格控制氮肥的用量。（2）科学进行水分管理：在青花菜生长季节保持土壤表面见干见湿，遇干旱季节，经常浇水。（3）根外追肥：移栽成活后，结合喷药用翠康钙宝1000倍+16%液体硼肥1000倍进行根外追肥。特别是在花球形成前后，对小花球和新叶喷施有一定的效果。
2、茎部空心或花球内部开裂
症状及发生原因：青花菜茎部变成空洞或花球内部开裂，花蕾上现褐色斑点，质地硬、带苦味，失去商品价值。主要是土壤中缺乏有效硼所引起的，同时气候干旱，水分供应不足，也宜引起空心。
克服措施：生产上除土壤补充硼肥外，要注意土壤湿度，尽可能不使土壤过干或过湿；适当推迟播种期，严格控制氮肥使用等栽培措施。应用翠康生力液1000倍+16%的液体硼肥1000倍于花球形成期开始每隔7天喷雾1次，连喷2~3次。
3、焦蕾、黄化
症状及发生原因：花球产生的毛花或形成焦蕾，有的花球松散、花蕾枯萎或黄化的现象。在生产中经常产生。特别是采用半保护性设施栽培的青花菜，其生长前期处于低温期，植株生长虽然缓慢，但若遇低温则有利于花芽分化，其现蕾早、容易产生小花球，生长后期进入高温期或棚室温度过高，花蕾发育受抑制，宜出现毛花、焦蕾等异常花球；临近花球采收期温度升高，花球生长发育快，如采收不及时，花蕾变得松散，且容易黄化，尤其白天温度过高，造成花球枯萎及黄化；贮存时间长的也易出像上述情况。
防治技术：半保护设施栽培的青花菜宜选择前期对低温不太敏感的中熟品种；要适期播种，培育壮苗；合理调节湿度；及时采收；不宜在常温下久藏。
4、花球变紫
症状及发生原因：花球表面出现的紫色现象，大多因花青素所致。主要是花球形成期遇到00C以下的低温（一般为零下1~30C）引起，但未受冻害，当气温恢复正常后，一般能恢复，但经二次低温冷害而造成的发紫，却很难恢复正常。
防治技术：花球形成期喷施翠康钙宝500~1000倍液可增强抗寒能力；当冷空气来临前的1~2天，将菜地浇透水，并叶面喷施绿亨天宝3000倍液可减轻紫花球的发生；也可于晚上在植株上覆盖双层遮阳网防寒。
5、风害
症状及发生原因：青花菜苗期及生长前期遇台风引起的中部叶片出现的发白现象。特别是在沿海地区，发生较严重。幼叶的细胞汁浓度较高，又有中下部叶片的保护，受害较轻；而下部的老叶抗性较强，也不太会受害；中部的叶片抵抗力较弱，受风害的直接危害大。
防治技术：受害的植株及时喷施爱多收5000倍液或蔬菜灵3000倍液可促进受害植株的恢复，同时要及时喷施杀菌剂，以防病害的发生与流行。
