大棚苦瓜着果后，也易遭受病虫危害而引起落果。受害后即使不落果，果实上形成虫伤口、疤痕等，也严重影响果实的商品性。更为严重的是，在施用农药时，果实易接触农药而受到污染，而且由于大棚的密闭，施药后药雾长时期在大棚内弥漫，使果实接触农药的时间大大延长，从而降低苦瓜的安全卫生品质。其实，不仅梨、桃、葡、柚等水果可以套袋，大棚苦瓜也可套袋。大棚苦瓜套袋后，上述问题可迎刃而解。套袋后，不仅虫子一般难以接触苦瓜幼果，就是病菌也减少了接触机会。特别是隔绝了农药的污染，因而可显著提高果实的安全卫生品质。套袋后果色也有明显的改观。不仅可显著提高产量，而且可大大改善品质。
品种选择应选择瓜蔓短、节间短、叶片小、抗逆性强、早熟、丰产、耐贮的品种，植株生长强健，抗病力强，雌花着生节位低，结果多，果肉厚，质嫩，品质好。
播种育苗早春茬12月下旬至1月下旬播种，2月中旬至3月中旬定植。秋延后茬7月下旬至8月中旬播种育苗，9月上旬至10月下旬定植。
营养钵育苗育苗基质以草炭和蛭石按体积比2∶1的比例混合，1立方米混合基质中再配入10千克烘干鸡粪（充分腐熟），混合均匀。将营养钵整齐地排入苗床内，给基质浇透水，待水下渗后播种，每钵用1粒种子，干子直播，播后覆盖0.5厘米厚的育苗基质。出苗前温度保持在25～30℃，夜间10～15℃。苗床每天早晨或傍晚用喷壶喷水1遍～2遍，以防基质板结、干燥。幼苗出土后，保持土壤干湿适度。如果幼苗长势弱，可用浓度为0.2%～0.3%的磷酸二氢钾水溶液进行叶面施肥。
适时定植幼苗3叶1心时定植，苗龄35～45天。定植方法和密度按照一般大棚苦瓜定植的方法和密度进行。
温度管理开花前，棚室内昼温保持在20～25℃。夜温13～15℃。开花后棚室内昼温保持在25～30℃，夜温12～15℃。若遇连阴天气，应加强保温措施，使昼温不低于18%，夜间不低于8℃。
肥水管理开花前以控为主，少浇水追肥，开花后开始追肥浇水。苦瓜根系喜湿不耐涝，每次浇水量不宜太大，要小水勤浇。一般2～3天浇1次水。结合施氮磷钾复合肥5千克～7.5千克。
植株调整利用棚室支架，在棚膜下20～30厘米处搭棚架，供瓜蔓攀缘生长。用吊绳引蔓上架。植株长到架顶时打尖，促侧枝芽萌发，侧蔓留1～2个雌花，座稳瓜后留2～3片叶打尖。
人工授粉扣膜后必须进行人工授粉才能正常结瓜。于早上8～10时采摘盛开的雄花，进行花对花授粉。
果实套袋开花坐果后进行果实套袋，袋长800毫米、宽80毫米、厚0.08毫米，为无色透明的聚乙烯薄膜袋。将薄膜袋套在果上，然后将薄膜袋口在果柄部用线绳捆在一起，但不能过紧，防止影响果柄横向生长，同时可保持一定的通气性。果实套袋可以防止农药直接喷到果实上。
病虫防治湿度大时易发生炭疽病、疫病，湿度小时易受蚜虫、白粉虱等的危害。炭疽病和疫病可选用80%炭疽福美等对口农药防治，或选用无农药残留的生物农药防治；蚜虫和白粉虱可用10%蚜虱净（又名一遍净、大功臣、吡虫啉、康福多等）2500～3000倍液防治。
及时采收开花后12天～15天为采收适期。采收不宜过晚，以免影响商品质量。果实连同套袋一并采收，并将果实同袋一起上市。
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