各种作物施用农药后，在一定时间内或多或少都有部分农药残留或超量残留在农作物体表、果实、子粒上，有的还能渗透到作物表皮的蜡质层或组织内部去，某些内吸性药剂还可被作物吸收运转到其他部位，使得在收获的农产品中残留微量或超量的农药或有毒的代谢产物。
尽量减少农药的使用 首先，选用抗病虫的品种是防治病虫害的最经济、安全、有效的方法；其次，播种前于隆冬或炎夏深翻耕地，可杀死部分病菌、虫卵，配合施入充分腐熟的有机肥，播种后加强田间管理，创造适宜作物生长而不利于病虫害发生的环境条件，可有效地减轻病虫害的发生。
不可使用禁用限用农药 根据农药的化学性质、毒性，在一些农作物上禁止使用剧毒、高毒、蓄积性强、持效期长的农药品种。如氯丹、三氯杀螨醇等，虽不属剧毒农药，但有累积中毒作用，禁止在蔬菜、茶、烟、药材等作物上使用；对硫磷、磷胺、甲基对硫磷、甲胺磷、久效磷等绝对禁止在作物上使用。涕灭威、甲拌磷和克百威等只能用于棉子、麦种、玉米种、甜菜种等作种子处理或土壤处理，严禁对其他作物喷雾。
务必注意农药的施用浓度、施用量、剂型、次数和施药方法 农药剂型中以乳油残留量较大，乳粉和可湿性粉剂次之，水剂较低。在施药方法上，种子处理、土壤处理、树干包扎法比喷雾、喷粉有较高残留。特别注意在接近农作物收获期施药，一定要选择毒性小、分解快的药剂品种并严格控制用药量、施用浓度、施药次数等。
严格遵守收获前的最后一次施药时间根据各种农药的安全间隔期，并按早治的原则，提前在农作物的生长期和害虫幼龄期与病菌初浸染时用药，可大大减少农药残留。
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