木薯虽然是多年生植物，但有一定的生长周期。在栽培上，从种植到收获，在热带地区有９至１８个月的，在有霜期的地区有６至７个月的。留种的必须在霜前收获，并做好种茎收获工作。
木薯插植后２个月开始结薯，１２个月后，产量基本形成，１４个月后，产量增长不大，故在热带地区，一般在植后１２个月收获，也有生长至１８个月才收获的。我国广东、广西、福建、湖南各地，多于植后８至１１个月收获，若４月插植，当年１１月至下年１月间均可收获。收获过早或过迟，都会影响淀粉的产出率。收获过早，肉质嫩，淀粉少；收获过迟，肉质木化，纤维素增加，淀粉含量减少。
木薯因品种和栽培地区不同，成熟期有别。木薯成熟的特征是：叶色稍转黄，基部老叶逐渐脱落，薯块表皮色泽变深且粗糙，以手用力摩擦薯块表皮时易脱皮。此时即可收获。收获木薯时，先将茎离表面６—１０厘米处用刀砍下，再用锄掘起块根，如土壤松软，可用手拔出。有的地方先用犁从薯畦的两边犁开，再用锄掘收，较为省工。挖掘时注意不要将块根切断或损伤，以免腐烂。种用木薯茎砍倒后，要认真贮藏，并需在降霜前收完，以免影响插植效果。
木薯块根收获后，一般不作鲜薯长期贮藏，应马上加工制取淀粉，以保证出粉率。若淀粉加工能力有限，可将木薯进行干燥处理，使薯块贮存较长的时间不致腐烂。干燥的方法可以用太阳曝晒，若收获前遇阴雨天气，可在室内烘烤干燥。鲜薯在干燥前，如经切片或剥皮处理，干燥效果更好。
木薯制干片的含水率以保持在１３％以内为宜，若含水率超过１７％，易腐烂或发酵。贮藏期间为预防仓库害虫与腐烂，仓库须通风设备良好、低温并能防热及防湿。
