农作物种子的贮藏极为重要，存放不好将丧失种用价值。为保障种子质量，在贮藏期间必须把好“五关”。
一是把好种子入库关首先要晾晒除湿。种子贮藏前必须经过必要的摊晾、曝晒，以控制种子细胞内部的生理生化变化，使种子含水量达到安全标准以内。其次选优去杂。入库前要将种子扬净，去除杂质，剔除秕种、芽种、虫种，选留具有品种特性的饱种。最后冷却入库。除确需热进仓处理外，大多数翻晒后的种子必须经过冷却后再进仓，否则易发生“结露”。
二是把好种子存放关对贮藏数量较少的种子，可将晒干扬净的种子放在具有防潮、防虫、防鼠、防雀的坛或缸等贮藏容器内。贮藏前，要将坛或缸洗净晒干，将种子放入后在上面覆盖5厘米～10厘米厚的干燥草木灰，再用塑料薄膜把口封好，放在干燥阴凉处，防止种子吸收大气中的水汽回潮，并保持较低的种温。这样就可以达到防潮、防虫、防鼠、防雀的效果，使种子长期保持旺盛的生活力。对贮藏数量稍大的种子，经晒干扬净后可采用囤装贮藏。囤装贮藏，要对囤底、囤围、囤面全部用塑料薄膜封起来，防止水汽浸入种堆内，并在囤底铺上 5厘米～10厘米厚的干燥草木灰，吸收种堆内水汽凝结水，防止种子霉烂。对仓库贮藏保管数量大的种子，一般采用如下方法：在种子晒干扬净进库前，必须做好仓库和贮存器具的清洁消毒工作，杀死仓库内害虫。每立方米仓容用80％的敌敌畏乳剂100毫克～200毫克消毒。即：将80％的敌敌畏乳剂1克～2克加清水 1公斤，配制成0．1％～0．2％的溶液进行喷洒，密闭仓库3昼夜后，打开门窗，让药散尽，即可将种子入库。
三是把好种子熏蒸关种子贮藏期间，一般都要及时进行磷化铝熏蒸。容器贮藏和囤装贮藏，用磷化铝片剂，按2片～3片/500公斤或 3克／立方米剂量投药，剂量小了达不到杀虫效果，大了影响种子生活力。要注意把磷化铝片用棉布包好，防止与种子直接接触而灼伤种子。并将贮藏容器或囤封好，防止磷化铝挥发散出降低药效和人畜中毒。库房贮藏则按 3克／立方米或 1片～1．5片立方米剂量投药。投放磷化铝要注意安全，要由专人投放，并戴上防毒面具。仓库要密封，施药后发现有漏气的地方应立即封堵。熏蒸地点要划定警戒线，不让人畜接近。投药不能集中一处，要分点施药，一般粉剂每个点小于40克，片剂每个点不超过15片为宜，以免自燃。熏蒸时间视温度而定，气温在 15℃以下需要5天～7天，15℃～20℃需4天～5天，20℃以上需要3天。
四是把好种子通风关种子贮藏期间要适时通风。以下四种情况可以通风。①仓内的温度和相对湿度高于仓外。②仓内温度等于仓外，相对湿度高于仓外。③仓内相对湿度等于仓外，温度高于仓外。④仓外温度低于仓内，相对湿度高于仓内，而仓外绝对湿度低于仓内。需要通风时，以上午7时～ 9时和下午5时～8时为宜。一般通风的季节在每年 9月至次年 2月。以下四种情况不可通风：①仓外温度高于仓内，相对湿度低于或等于仓内时不宜通风，否则容易引起表面层种“结露”。②一天当中，最低温（这时相对湿度较高）、最高温出现时不可通风。③雨季、台风、寒流到来时不可通风。④气温上升阶段（一般每年的5月～8月份）避免通风，尽量保持种子原有的干燥程度和低温状态。
五是把好种子检测关种子入库后，库房需配备湿度计、曲柄温度计等仪器。对库内温、湿度，坚持 3天一检查。同时根据种子的不同特性，定期或不定期地测试种子的纯度、发芽率。纯度一般采用电泳测定、酶谱测定和病理测定方法。发芽率一般选取去荚、带荚种子 100粒，用 1％次氯酸钠溶液消毒10分钟，清水反复冲洗后放入垫有双层脱脂纱布培养皿中，在 25℃±1℃恒箱内进行暗萌发试验。去荚、带荚的种子各设 3次重复试验，最后算出平均发芽率，即为被测种子的发芽率。
种子贮藏除把好“五关”外，在贮藏过程中，还要注意品种分开，防止混杂。注意种、粮分开，防止种、粮不分。注意种肥、种药分开，防止肥药伤害种子。在雨后还要及时检查种子是否发生回潮或“出汗”、发热、生虫、发霉变质等现象，以确保种子安全贮藏。
