水稻产生缩苗症的主要原因是：缺磷缩苗、缺锌缩苗及盐碱害缩苗三种，其主要防治方法是：
一、缺磷缩苗
一般在缓秧后的粉蘖期发生，表现为生长缓慢、植株矮小，叶形细长直立，叶色暗绿，叶簇顶端整齐，叶枕距显著缩短，部粉蘖，叶尖发红，老叶呈棕红色甚至死亡。造成的主要原因（一）土壤缺乏速效磷；（二）土温、水温低、或土壤中含硫化氢、亚铁等还原性有害物质， 使根的吸收能力降低；（三）氮肥施用过量，有效养分失去了相对平衡。
防治措施是根据“测土施肥法”测出的磷素有效成分数据确定合理的施磷量。
二、缺锌缩苗
水稻轻度缺锌，基部叶片出现褐色斑点，中部缺锌，叶色浅绿，锈病增多，中脉失绿变白；重度缺锌叶枕距缩短，生长受抑制，新叶变小，植株矮小，阻碍粉蘖，黑根严重，抽穗延迟，减产严重。造成的主要原因是，土壤有效锌含量低，或施用磷肥、氨肥过多、氨锌比例失调；此外有机肥施量多，加上长期积水，也易造成缺锌。主要防治措施为：667m2（亩）施硫酸锌1~1.5kg（公斤），或在缓秧后、发生缩苗浅追施0.1％~0.2％的硫酸锌水溶液。
三、盐碱害缩苗
此种缩苗是盐碱、缺磷、缺锌的并发症，多发生有滨海稻区，主要表现为叶片自上而下纵卷似青枯，根系很快坏死，叶片无吐水现象，下部叶片尖尖纵卷后自叶基开始褪绿，并向上发展，直叶片枯死。造成主要的原因是：土壤或灌溉水的盐碱含量高，或灌溉水的酸碱值高。主要防治措施：盐碱土稻区要搞泡田洗碱，在水稻生育期间要根据水稻不同生育期耐盐碱能力，严格掌握灌溉水含盐碱的标准，达到灌溉水畅通并使田面与排水沟水位保持40cm以上的水位差，以降低稻田酸碱值。
