树桩盆景修剪一般是蟠扎基本造型后再进行的，有平剪、选剪等。但也有纯粹用修剪方法进行造型的，如岭南派盆景造型就是用纯粹修剪的“蓄枝截干”的方法进行的。这是受中国画法中“鸡爪枝”“鹿角枝”造型的影响，“蓄枝”是指选定技位后蓄养技条，包括将来要成为树干的部分和根系，“截干”是指把不符合造型要求的树干、枝条及根系截短或截除，它运用于岭南盆景栽培造型的全过程，树坯经挖掘后按造型要求长短、高矮进行截干截根，当定植萌发新技后经选定技位，矫正带引技形朝向，蓄养到粗细合度时，按照造型要求的长、短、粗、细及时进行剪截，接着萌发新技，又再次进行剪截，如此反复交替，蓄枝截子，直至“鹿角”、“鸡爪”技成型。而我国另一些盆景流派的修剪方法是“重扎轻剪”，或“轻扎重剪”，或“重扎重剪”等。
树桩盆景整个创作过程的剪枝可分为科学剪枝法、技术剪枝法和艺术剪枝法，当作品创作完成，定型后，还要进行一项长期性的修剪，即控制剪枝法。
（一）科学剪枝
应用植物生理学作指导，以掌握各种植物 生长规律及特性，根据树种的不同、长势的强弱、季节的变化有针对性地进行剪截，以避免盲目修剪植物带来体内堵塞、生长失调及窒息枯萎的不良后果。桩景层次过多，枝叶过密，或是上层枝片过大，会造成植物通风不好，光照不足，出现死枝、病虫害现象。植物的修剪必须符合桩景自身的生长特点，树冠造形宜于采用收尖渐变，结顶自然，不搞大屋顶的造型手法。科学剪枝的目的是应用植物生理学知识，正确地引导植物生长，充分发挥它们的生长优势，以便更好地控制、利用和改造它们。
（二）技术剪枝
技术剪枝是为构图服务的，它要求桩景在外形上给人产生一种直观的形象的效果；也是为了突出盆景意境魅力的一种手段。它在很大程度上是一种符合于桩景的意境和艺术表现的技法，又是服务于内容的一种外在的技法。如果技术剪枝掌握得不免娴熟、不免准确，应会制约意境的深远，也将不能更好地表达主题。众所周知：一盆有价值的桩景是与技术修剪功底的作用分不开的。我们盆景流派甚多，风格各异，在桩景技术修剪技法上也各有千秋。
（三）艺术剪枝
艺术剪枝是要赋予桩景以生命和灵魂，达到景有尽而元穷的境地，追求的是桩景意境的深远，因树枝是桩景表达神韵和深远意境最主要的对象，因而它的剪枝技法更注重于桩景整体的结构。它严谨的结构表现在树枝的疏密、聚散、藏露、曲直、顾盼等艺术造型手法上。树枝的神韵应以苍劲、飘逸、动感来加以丰富形象的特征。从而产生意境，使作品达到形神兼备、情景交融的艺术效果。
艺术剪枝在某种程度上说又有很大的随意性，它可不受任何形式的束缚而“随心所欲不逾矩”地剪截，但万变不离其宗。总之盆景的最终目的和其它艺术品一样，是要让观众在感性的具体艺术形象中得到思想的启发、情感的陶冶和美的享受，这也是一切真正的好的艺术作品所必须具有的基本特点。
（四）控制剪枝
控制剪枝是对成型后的桩景景观的维持和再创作，这是一项十分重要而长期、繁杂的工作，它由抹芽、摘心、疏枝和截枝而组成。
（1）抹芽：抹去那些没有前途的不定芽，让桩景健康生长。其实这也属于科学剪枝范围。
（2）摘心：不仅能抑制枝条的过快生长，而且在一定时间之内还能保护桩景原有的美感，是很好的抑制变型的措施。
（3）疏枝：是针对桩景长期生长从而主枝分枝增多、密度过大，造成不透风、光照条件差，所产生的叶子发黄和病虫害的现象，有碍观赏而采取的一项措施。这也属于科学剪枝范围。
（4）截枝：定型后的桩景经过长期的生长，因枝条的粗度和长度，已不能保持树姿的原有景观，便通过剪截、疏剪和其它的剪枝措施加以控制。这也是一个再创作过程，具体实施可将每组枝条缩短至一定比例（这一比例的标准是新生枝条容易生长到所剪枝条的粗度），不造成脱节现象。
剪截不仅可使植物得到生理平衡，也可使某些不理想枝条重新得到改造，以至产生更佳的观赏效果。应注意的是：有些树种萌芽力强，有些树种萌芽力弱；还有开花、结果的，要有针对性地剪截。避免使呕心沥血的作品造成不必要的损失。
