辣椒生长期较长，需肥量较大，一般在苗期的时候可以少量的施肥，可结合叶面追肥，选用适当的含钙、镁、铁、锰、硼等微量元素肥料；在盛花坐果期对氮的需求量较大，此时可适当追施磷酸二铵等。
辣椒定植后，叶片、花器官和果实形状的变化，都可以反映出植株的养分状况。养分状况适宜时叶片宽。，氮素过多养分不平衡则长成狭长、扭曲的船底形叶片；养分状况适宜时，产生短花柱花；养分缺乏时，产生中花柱花；进一步缺乏会产生花柱花，这种花不能自花授粉，容易落花。养分状况适宜时，果实生长发育快，形成正常果实；养分缺乏时果实不能正常膨大或者生长发育慢，延迟采收时间。
辣椒定植时，可以采用粪水稳苗的方法来移栽，或者在浇缓苗水的时候，结合追施稀粪水，一般每667平方米浇水量为40-60立方米。当蹲苗结束以后，门椒以上的茎叶已经长出3-5节，果实长至核桃大小时，可结合浇水追施腐熟的人粪尿，每667平方米施用稀粪水的量为2000-2500千克，浇水量为每667平方米50-70立方米。15天后追二次肥料，施用量和浇水量同前。这个时期以后，辣椒植株秧果繁茂，短枝分生很多，进入果实采收期。这时为了防止雨季植株倒伏，可以结合培土，每667平方米追施腐熟有机肥1500-2000千克，或者硫酸铵20-25千克，有利于植株壮秧保果。
培土后要及时浇缓水，促进植株根系恢复正常生长。一般每667平方米浇水量为50-70立方米。进入雨季以后，为了防止雨后脱肥，可追施化肥一次，每667平方米追施硫酸铵20-25千克，以促进植株继续开花结果。雨季过后，辣椒植株进入复壮期，需及时追肥和浇水，追肥和浇水交替进行。一般追肥2-3次，浇水4-5次，追肥量为每667平方米40-60立方米。天气凉爽后，可以追施粪水，促进早开花，早坐果，早成熟。开花结果期，也可以进行叶面追肥，喷施0.5%尿素加0.2%-0.3%磷酸二氢钾溶液，以增加辣椒结果数和提高果实品质。
