番荔枝鲜果易烂,不易贮存,一般放在稻草中后熟几天就变软,若留在树上会裂开、腐败，而不是变软。为防果实采后腐烂，先用流水把果实清洗，再用50-52℃苯莱特药液（有效0.5成份%)药液浸果5分钟,然后用流水降温,沥于,打蜡,以降低呼吸强度,应于鲜果末软熟之前上蜡,浓度以0.3%-10.0%为宜.上好蜡的果实要用纸箱馐,内用软纸垫隔,然后放在冷冻保鲜库中冷藏.由于番荔枝鲜果在15.5℃以下受寒害,冷藏温度不宜太低,一般在16℃条件下,相对湿度90%以上环境下贮藏较合适,可存放半个月左右.番荔枝不仅适应性强‘粗生易栽和病虫害少，而且经济效益高。
对于耐藏性极差的番荔枝来说，低温乃是降低其呼吸速率，延长其贮藏期的重要条 件.然而，番荔枝在较低的温度((10℃以下)下贮藏，会与其它热带水果一样，出现冷害，表现在果皮逐渐变黑，呼吸机制严重破坏，果实坚硬，不会软熟。而温度过高则使果实软熟加速，腐烂加重.我们研究认为，番荔枝贮藏适温，应根据果实成熟度情况确定，低熟度(八成以下)果实以18 ~20℃,中熟度(八一九成)果实以15一18℃为宜，而高熟度(九成以上)果实以12 ~ 15摄氏度最佳.
气调贮藏可以保持果实硬度，明显抑制果实软化。通过免疫检测发现气调下与pg酶相关的蛋白质表达受到了抑制，使pg酶的活性降低。在20℃下，20%的co? 可抑制番荔枝果实1,5一二磷酸核酮糖梭化酶的活性，阻碍叶绿素的损失，保持果皮绿色，延迟果实衰老。
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