西甜瓜苗期病害重要有猝倒病、立枯病、炭疽病、沤根等；
苗期病害的症状
1.猝倒病：是西甜瓜苗期的一种重要病害；小苗受害，在近土面的小苗胚茎基部先呈水渍状病斑，随后病部变成黄褐色，干枯收缩成线状，在子叶凋萎前，小苗便猝倒；
2.立枯病：患病小苗茎部发生椭圆形暗褐色病斑，早期病苗中午萎蔫，早晚恢复，病部逐渐凹陷，发展绕茎1周，并缢缩干枯，植株枯死；发病轻的小苗仅在茎基部产生褐色病斑，小苗成长不良，但不枯死；
3.炭疽病：炭疽病在西甜瓜整个生育期都有出现；新苗期发病，重要是子叶受害，多在叶边缘发生圆形或半圆形病斑，呈褐色，上边长出黑色小点及淡红色粘稠物；
4.沤根：新苗出土后长期不发新根；幼根外皮锈褐色，逐渐腐烂，不发新叶，病苗很容易从土中拔出，严重时病株萎蔫枯死！
苗期病害的综合防治和治疗
1.苗床土的处理：西甜瓜苗期的立枯病和猝倒病均是土传病害，在育苗前15~30天，对营养土进行消毒！可用70%噁霉灵可溶粉剂3000倍喷洒于营养土上并充分拌匀并堆沤，用量为每方营养土利用70%噁霉灵可溶粉剂5～8克！也能够按上述用量在灌水焖苗床前将药剂施于营养钵土的表面，使其随水渗入营养土中；
2.培育壮苗：苗床夜间要做好保温工作，避免冷风和低温侵袭，防止小苗受冻；白天应增加通风换气，降低苗床温度和湿度，使幼芽成长健壮，提升抗病力；西甜瓜出苗适宜土温为20摄氏度~25摄氏度，出苗后的白天温度抑制在25摄氏度~30摄氏度，夜间15摄氏度~16摄氏度，订植前5天开始降温炼苗！西甜瓜苗在3片真叶以后，如果瓜苗拥挤，很易疯长，重要起因是群体内部光照较弱，应堤防拉开苗钵间距，使瓜苗充分受光！夜温保持在15摄氏度以下，床土不宜过湿（瓜苗中午不萎蔫为准）；若苗床需浇水，应以晴天上午10时~12时为宜，浇水后应放风降湿，提升土温；小苗3片真叶左右时，可进行叶面喷肥，提升瓜苗的抗病性；
3.药剂防治和治疗：当苗床开始零星出现立枯、猝倒病苗时，要立即拔去病株，同时选用70%噁霉灵可溶粉剂3000倍+植物成长调节剂、或30%醚菌酯悬浮剂2000倍+植物成长调节剂、70%甲基托布津可湿性粉剂800倍+植物成长调节剂进行喷雾，要小心三种药剂轮换利用；
