肥害。肥害是因肥料施用不当对蔬菜秧苗造成的危害。肥害初期表现从下部叶片开始，中午萎蔫早晚可恢复，严重时早晚也难恢复，其发生原因是配制营养土时掺入过量化肥或未熟的畜禽粪，造成土壤水分渗透压力过大，根系吸水困难而"烧苗"。
防治方法应以预防为主。在配制营养土时要使用搓碎过筛、充分腐熟的有机肥，并严格按技术要求配比，追肥一定要结合浇水进行。一旦发生肥害，要立即浇大水，可减轻或缓解症状。
药害。日光温室蔬菜生产由于空间小、密闭性好，农药使用不当易产生药害。发生药害的原因：(1)一些杀菌剂如代森锰锌、百菌清、杀毒矾等配制浓度过大。(2)某些蔬菜对一些杀虫剂十分敏感。如黄瓜幼苗对辛硫磷、六六六等十分敏感，即使少量使用也会发生严重药害。(3)一些激素类农药使用不当、盲目加大用量。(4)农户不按规定操作使用农药，如高温下喷施波尔多液、代森锰锌，烟雾剂放的位置不当。一旦发生药害，喷施"植物动力2003"等营养药，可缓解药害。
氨害。氨害是日光温室内空气中的氨气浓度达到一定程度时对蔬菜造成的危害。造成氨害的原因：一是温室地面撒施鸡粪、尿素、碳铵等肥料，溢出氨气并不断积累；二是寒冷季节温室连续多天不通风，施入土壤中的畜禽粪、二铵等肥料分解，放出氨气并在温室内不断积累。
蔬菜发生氨害时，常表现为叶片急速萎蔫，随之凋萎干枯呈烧灼状。防止氨害：一是选连续晴天时结合浇水追肥，饼肥和其它有机肥要及时翻入土内；二是在追肥后及时通风，防止氨气积累，可以用PH试纸检测温室内的氨气含量，用PH试纸沾取棚膜上的水珠，当PH值>7时，氨气存在，要及时放风；当PH≤7时，说明温室内无氨气。
寒害和热害。日光温室生产不注意保温和增湿易造成寒害，温度过高又易造成热害，一般只要落实好常规的保温措施，温室内温度不低于0℃就不会直接冻死蔬菜苗，但是-些喜温蔬菜如黄瓜、茄子等，当夜间温度连续5天低于8℃时会出现寒根，进而导致沤根死苗。
防止寒害：-是选择优良棚型，如冀优1型、2型、高邑1型等，并按标准建造；二是整地时多压作物桔秆：多施有机肥能够提高地温；三是挖防寒沟；四是寒冷季节加盖双层草苫，外加一层防寒膜，并晚揭早盖；五是进口处注意保温，开口处盖小房，进口内外加棉门帘，并在温室内用塑料膜围-小屋状的缓冲间，防冷风直接吹进温室降低棚温。
热害。多是人为原因造成的，如晴天中午不注意放风，致使温室内温度高达40℃以上，幼苗过度失水而干枯。只要勤看温度计，超过要求温度及时放风降温就不会发生热害。
病害。日光温室中温度高、湿度大，有利各种病害发生。实践中防治病害常采取农业防治和化学防治措施并举，采用种植抗病品种、增施有机肥、起垄栽培、放风、扣地膜和膜下暗灌等农业措施，都会减少病害的发生。
闪苗。天气连阴几天后骤晴，就急于拉开草苫晒苗，常造成植株突然萎蔫，甚至全株死亡，群众俗称"闪苗"。
预防"闪苗"，一是阴天期间仍要坚持拉放草帘，可晚拉早放，天气寒冷可在温室前坡前端和后坡尾部将草苫卷起1米左右，让秧苗接受-些散射光；二是天气骤晴后，在早晨太阳出来到10点前全部卷起草苫，不要放风，10点后阳光增强时放下一半草苫(可以隔一领放一领)如果秧苗出现打蔫时，可以向蔬菜苗上喷洒清水，提高温室内空气湿度，防止叶片失水，要连续观察2-3天，直到秧苗适应晴天后可转入正常管理。
气害。气害是指有害气体对温室蔬菜造成的危害。有害气体多是人为因素造成的，如温室内生煤火或烧木柴产生大量烟雾和SO2气体。用烟雾剂农药熏棚时药量过大也会对蔬菜秧苗造成危害。防止气害要做到：一是温室加温必须用烟囱；防止有害气体进入温室；二是熏棚时严格按药剂使用说明确定用药量，不要盲目加大药量。
除草剂为害。蔬菜幼苗对多种除草剂极为敏感，误用除草剂或使用除草剂的喷雾器或使用不对路的除草地膜，都会造成秧苗受害。蔬菜受除草剂为害后很难补救，即使能恢复生长也将会造成减产减收。所以要提高警惕，严防误用除草剂、除草地膜和喷过除草剂的喷雾器。
