植物生长三要素氮、磷、钾肥，氮肥可促进花草枝叶生长；磷肥可促进其花、果实形成；钾肥可促进茎干和根部的生长。由于盆景是在有限的盆钵空间。有限的培植土内培植，有机物被细菌分解成无机盐被根所吸收，随着红豆杉生长的消耗，盆土内的养份渐渐缺乏，导致不足以供应生长的需求。
盆景内虽采用配制好的营养土，购买回去后的三个月内仍不要施肥。红豆杉盆景忌施生肥、浓肥，追肥应以氮磷肥为主，不可过浓。最好结合施用有机肥，这样利于根群的发展，对于整个植株生长极为有利！
只有当叶片叶色变淡、植株瘦弱、叶片呈黄白色、叶边，叶尖出现“干烧边”，叶片早衰掉叶时，施用1000倍液尿素、硫酸钾800倍速溶优质复合肥溶液去除沉淀物后浇盆土，每隔一个月左右施一次，最好采用经过充分腐熟的淡豆饼肥水（约10%～15%）施时避开树干处，尽量沿盆壁施，半个月施一次。
施肥后第二天浇再一遍清水，以防浇的肥太浓稀释一下，以上两种肥料可交替使用，也可每盆挖两个小坑在里面放五六粒尿素和七八粒优质复合肥。
新购的红豆杉盆景内已经采用配制好的营养土，因此， 3个月内不需施肥，之后可每隔2到3个月施肥一次，肥料以饼肥为佳，施肥时应注意沿盆边操作，避免碰到盆景根部。
一般用含氮、磷、钾的复合肥或有机肥。复合肥采用浇施，溶于水后再浇施，浓度在0.5%-1%；有机肥采用埋施的方法。为增强植物的观赏性，可给植物适当喷洒些磷酸二氢钾等叶面肥。
同时，不同的氮、磷、钾肥施用水平对红豆杉盆栽苗的生长量、枝叶产量和紫杉醇含量有显著影响，影响效应从大至小依次为氮、磷、钾。
