瓜呵护地种植，由于连年栽培，首先要克服的就是土传病害及连做障碍。其最有用的解决措施就是嫁接，也叫换根种植。嫁接砧木的选用，直接关系到嫁接种植的成败和经济效益的高低。
用来嫁接西瓜的砧木许多，有葫芦及葫芦的变异瓠瓜、南瓜、冬瓜、野西瓜等。其中最常用的是葫芦和南瓜。自上个世纪60年代，西瓜嫁接技术从日本引入我国，葫芦砧木就一向被沿用，而且推广面积最大。个别老瓜区，长期选用同一种品系，形成了抗枯萎病不彻底、有一些死苗的征象。冬天阳光温室育苗，在较为寒冷的年份，其耐寒性不如南瓜。
近几年，用南瓜嫁接西瓜的面积在不时扩展，但由于瓜农对品系的选用及南瓜本身特征不够了解，相应的种植技术不配套，也发生了部分问题。如有些南瓜品类嫁接成活率低；有的能成活，但植株民势弱；有的长势好，产量高，但嫁接适时短，易旺长，有时瓜皮厚、肉硬等。
到底该怎样选用砧木呢？
（一）看砧木与西瓜的亲和能力
亲和力包括嫁接亲和力和共生亲和力。嫁接亲和力是指砧木与西瓜的愈合能力，嫁接易愈合成活率高则亲和力高，反之则低。共生亲和力是指嫁接成活后的共生能力，能正常结瓜，无生育不良征象，即共生亲和力强。
葫芦体现了稳定的嫁接亲和力和共生亲和力。选用的品系有韩国砧木、长瓠瓜、圆瓠瓜、牛腿葫芦、青杆葫芦。杂交种有韩国的玄和、日本的相生、郑州果树所的超丰F1等。
对南瓜而言，不是全部的南瓜品系都适宜嫁接西瓜。个别地方曾选用产自云南的黑籽南瓜就发生了个别共生不亲和的征象。现多采用通过改良的土佐系品系，如日本南瓜砧木、铁木真、掘金龙等。新引进的小粒黄籽南瓜新锐天王亲和力也不错。
（二）看砧木的抗病性
西瓜嫁接的重要目的是避免枯萎病，因此必需选抗枯萎病强的砧木。在南瓜砧木中，改良后的土佐系列白籽及小粒黄籽，抗枯萎病能力最强。有时在成长后期，有白粉病感染征象，须堤防防治和治疗。
葫芦砧木为避免西瓜枯萎病起到不错的作用。但由于个别老瓜区，多年一向利用同一品系的普通葫芦嫁接，枯萎病菌的一个分化型——葫芦菌，在个别抗病弱的葫芦砧木品类上酿成一定的侵害率。但个别杂交种抗病性也不错，比普通葫芦有更大提升。
（三）看砧木的耐寒性
呵护地种植西瓜，大一些时间都在较寒冷的季节，选用耐寒性强的砧木品系尤为主要。南瓜的耐寒性最好，其根系的低温伸长性好。葫芦比南瓜稍差，但个别葫芦的杂交种耐寒性也很大。
（四）看对品质的影响
嫁接对西瓜外形及品质的影响直接与经济效益相关。选用对品质无影响或影响小的砧木特别主要。实际利用中，南瓜砧木有使瓜皮增厚、品质下降的趋势。土佐系改良的品系有所革新，小粒黄籽南瓜要好些。葫芦砧木和西瓜共砧不存在此缺陷，其嫁接出来的西瓜品质良好。
综上所述，葫芦砧亲和力好，果实品质稳定，但抗寒、抗病性稍逊于南瓜，应力求选用抗病耐寒的杂交种品类。可选用的品系有：韩国砧木、韩国玄和、日本相生、郑州果树所的超丰F1、山东牛腿葫芦、青杆葫芦等。但葫芦砧也不宜选用成长势太强的西瓜品系嫁接。小粒黄粒南瓜新锐天王长势中庸，对品类影响较小，可选用。
嫁接西瓜砧木的选用要综合考虑，并配以相应的管理技术：
不宜用成长势太强的西瓜品系作为接穗；一定按氮：磷：钾＝1∶0.5∶1.2施肥，尤其不能偏施氮肥，苗期减少用肥的1/3；结瓜期以前小心调节肥水，调节好大棚内温、光、湿度；勤整枝，以防旺长；子叶苗防疯长，以延长嫁接适时；苗龄不可过长，以30天为宜，防根系老化；留第三雌花坐瓜，不在18摄氏度以下温度坐瓜，以防皮厚、起棱；接穗宜选用瓜瓤不十分硬的高糖品类；增施钾肥要用硫酸钾，不施含氯肥料，以提升含糖量。
