木瓜花叶病毒病是近年来木瓜产地普遍发生的毁灭性病害。植株一种下后就会发病，叶片上出现斑驳型黄色花点，新叶密集紧束，迅速失绿并变硬脆，易折断，其后不发新根，不长新叶，植株越长越小，并逐渐枯萎死亡。感病植株无法开花结瓜，产量低，品质差，必须采取综合措施进行防治：
在木瓜幼苗定植成活后，根部淋施一次1000倍硫酸锌、600倍植物病毒疫苗混合液，每株淋1～1.5公斤左右，以削弱木瓜植株体内的病毒活性，能明显减轻木瓜花叶病毒病的发生和危害。在木瓜植株生长发育过程中，必须每15～20天叶面喷洒一次600倍植物病毒疫苗、1500倍神农素螯合肥、1000倍硫酸锌混合液，或800倍病毒必克，1000倍壮丰优、1000倍硫酸锌混合液，均匀喷湿所有的叶片，以开始有水珠往下滴为宜，可防治木瓜花叶病毒病的发生和危害。
另外，要注意防治传播花叶病毒病的昆虫如蚜虫、蚧壳虫和白粉虱。在木瓜生长发育过程中，注意检查茎叶，发现有上述害虫发生危害时，及时连续喷洒2～3次1000倍蚜虱净水溶液，或1500倍蚧虱净水溶液，或1000倍乐斯本水溶液进行防治，每7～10天喷洒一次，均匀喷湿所有的茎叶，以开始有水珠往下滴为宜，即能杀死上述害虫，避免传播花叶病毒病。
