温棚种植芹菜，常受斑枯病、叶斑病、菌核病和软腐病等病害的为害，影响芹菜成长。下降产量和品质。因此，对芹菜病害应采取综合防治和治疗办法，重要抓好以下几点。
一、实行轮做。实行2－3年的轮种，可减少病原物的积累，减轻病害的产生。
二、搞好种子处理。用48摄氏度的温水浸泡种子30分钟，可有用杀死附着于种子上的斑枯病和叶斑病病菌。浸种时应不时搅动使之匀称受热，浸种后用清水淘洗，晾干后播种。如果种子里夹有菌核，可用10％的盐水漂除，随后用水冲洗，以减少种子带菌。值得小心的是，温汤浸种对芹菜种子发芽率稍有影响，播种时用种量应加强10％－20％。
三、实行覆膜种植。覆膜种植有制约菌核病传播的作用。覆膜免耕还可减少植株损害，从而减轻软腐病的侵害。
四、严格抑制温度湿度。高温高湿是芹菜病害出现的主要条件。温室芹菜在入冬后白天应抑制在15－20摄氏度。夜间抑制在8摄氏度。温度偏高时应准时放风，偏低时应加强覆盖物。浇水要适宜，宜选在晴天上午进行。浇水后结合降温进行放风排湿，避免湿度过大。阴天或低温天气要防止浇水。土壤过湿时可撒干细土下降湿度。
五、合理施肥。要施足基肥并增施磷钾肥和硼肥。培育出健壮的植株，提升自身的抗病力。
六、适期施用药剂。如发现中心病株，应立刻拔除，并随即全面施药防护，抑制病情，避免蔓延。一般7－10天1次，间断用药2－3次。对斑枯病可选用75％百菌清可湿性粉剂600倍液、64％杀毒矾可湿性粉剂500倍液、65％代森锌可湿性粉剂500倍液等喷防；对叶斑病可选用75％甲基托布津可湿性粉剂600倍液、50％多菌灵可湿性粉剂500倍液、70％甲基托布津可湿性粉剂800倍液等喷防；对菌核病可选用50％速克灵可湿性粉剂1500倍液、50％多菌灵可湿性粉剂500倍液等喷防；对软腐病，在拔除病株后撒石灰于病穴消毒，同时选用72％农用硫酸链霉素粉剂4000倍液或20％络氨铜水剂400倍液全面喷防。
在冬春阴雨、冷湿条件下，在大棚施放烟剂防治和治疗病害，不加强湿度，成效优于喷雾法，且防治和治疗较为彻底。对斑株病可选用45％百菌清烟剂，每次每667平方米用药250克；对菌核病可选10％速克灵烟剂，每次每667平方米用药250克。施药办法：于傍晚将烟剂发点布放在室内过道上，由里往外逐一暗火点烯，着烟后立刻密闭过夜。一般7－10天施放1次，间断施放2－3次。
