马铃薯脱毒原种是用呵护设施下生产的脱毒微型薯作种薯，在高海拔冷凉山区、有一定隔离条件的土地上繁殖优异种薯的一种生产方式。重要以繁殖马铃薯脱毒良种为目的，与大田种植方式有所差别。
一、精细整地、浅种浅盖
在选择质地疏松（砂性强）、肥力好地块的基础上，进行深翻和两三次耖耙碎垡，使耕作层垡细土松。用牛抽沟播种施肥后，用锄头进行浅培土，盖种深度3～5厘米，才能保证出苗齐、快。
二、分次施肥、合理密植
脱毒微型薯（单薯重2—10g）种薯小，芽眼少且芽弱，一次性施60～80千克公用肥作基肥会烧种薯和苗，要求一半作基肥，一半作追肥。脱毒微型薯种薯个头小，成长发育而成的植株分枝也相对矮小，加强播种密度才能获得高产。2—5g重的种薯，密度6000—8000株/亩，5—10g重的种薯4000—6000株/亩。单垄栽培，行距0.5—0.6米，株距0.18—0.25米。
三、适期播种、准时中耕除草
3月下旬-4月上旬播种为宜。宣威春寒比较严重，适期播种很重要，如播种过早，出苗时较长时间处于干燥，又无灌溉条件，植株尚未成长发展，地下就结薯争夺养分了，自然不能获得好的产量。要解决好这一矛盾，只有恰当推迟播种期，使之出苗后接近或进入雨季，田间土壤商情好，有利根茎叶成长，充分发挥马铃薯速生性优势，很快长成茂盛而健壮的植株，从而获得优质丰产。准时中耕除草在原种生产上也是主要环节，如把大薯块作种说成娘壮儿肥，那微型薯作种繁育原种就是娘弱儿瘦，弱瘦的植株与杂草的竞争力就比较差，应尽早薅锄，晒死杂草，促使新苗成长。
四、提早追肥、分次盖土
马铃薯出少数生育期比较长的晚熟品系外，一般不进行追肥。繁育原种采用追肥是考虑脱毒微型薯的出苗问题，因此，齐苗后尽早结合中耕进行追肥，促使小苗迅速成长。一般在齐苗后一周内进行。脱毒微型种薯作种，幼芽弱小，成长量也就小，必需分次盖土，一般盖土2至3次。 保证植株有用光合绿叶面积不被所盖土掩埋，才能使植株充分成长发育。
五、防治和治疗病虫害、去出杂劣
大春天节繁育原种，进入六月中下旬，一方面雨水增多，空气湿度大，温度适宜晚疫病产生，另一方面，马铃薯植株进入开花结薯期，抗病力下降，晚疫病和蚜虫易出现，一旦出现应准时防治和治疗。马铃薯原种繁育，田间混同株或多或少都有，为保证种薯质量，应仔细去出。对个别早熟品类或结薯早的品系，用内吸性锄草剂药液喷施，杀死植株及薯块，施药时喷头放上罩，不喷着旁边的植株，对结薯晚的品类，在结薯开花前直接将杂株拔出。
七、适期早收、分级包装
马铃薯原种生产的目的是生产健壮、优质和增产优势强的种薯，和生产加工原料或作直接消费的商品薯有一定差异，应早收10—15天，减少茎、叶里的病毒进入种薯，减缓种薯退化速度，延长利用年限及提升增产幅度。收获时选择晴天，土壤田间相对持水量低于30—40%时，薯块不粘土为好，以利室内保管和贮藏，在室内翻晾40—50天就可分级装袋贮藏和调运了。
