芹菜的生理性障碍有烧心、空心、叶柄开裂和缺硼症。以上生理性障碍严重地影响了芹菜的成长，下降了产量及品质。
一、烧心
1、症状。开始心叶叶脉间变褐、逐渐叶缘细胞坏死，呈黑褐色。在生育初期很少形成，多在11～12片真叶时开始形成。
2、出现条件和 因素。烧心在高温、干旱、施肥过量的条件下容易产生。高温能加速生育速度，促使植物对氮、钾、镁等元素的过多吸取，从而影响对钙的汲取。而烧心是由缺钙导致的。在干旱条件下，由于根系对钙元素的汲取能力减弱，易导致植株缺钙，越是酸性土壤则形成越重。
3、防治和治疗对策。首先要防止高温干旱，进行适温适湿管理；对酸性土壤可施用消石灰调节到中性或接近中性；施氮、钾、镁等肥料要适量。一旦产生烧心症状，可用0.5%氟化钙或硝酸钙溶液向叶面喷雾。
二、空心
1、症状。空心是一种生理老化征象，形成的位置是叶柄，是叶柄髓位置和输导组织细胞的老化，细胞液胶质化失去活力和细胞膜出现孔隙。多从叶柄基部向上延伸，在同一植株上外叶先于内叶，由叶基到第1节间产生较早。叶柄空心位置呈白色絮状，木栓化组织增生。
2、产生条件和 因素。空心在沙性大的土壤中出现较多，进度也快；肥分不足或后期脱肥时也有形成；产品过熟和久藏失水、过多喷施赤霉素等，土壤干旱或温度太高、太低、芹菜受冻也易形成。
3、防治和治疗办法。应防止在沙性过大的土壤上种植；除施足基肥外，在成长发育过程中要准时追肥，如发现叶子颜色转浓发生脱肥征象时，可用0.1%尿素液肥等进行根外追肥。用赤霉素处理时，应准时喷施氮肥。
三、叶柄开裂
1、症状。多数体现为茎基部连同叶柄同时开裂，不仅影响商品品质，而且病菌极易感染，致使芹菜发病霉烂。
2、形成条件和 因素。多在低温、干旱条件下，由于生育受到严重控制所致。其它，在突发性高温、多湿的条件下，由于植株吸水能力过强，组织充水时也能产生。
3、预防方法。进行正常的适温、适湿管理，特别在温室内生产芹菜时，要增加保温方法；深耕土壤，多施有机肥，促使根系正常成长发育，增强其抗旱及抗低温能力。
四、缺硼症
1、症状。其体现为叶柄异常肥大、短缩，并向内侧弯曲，弯曲一些的内侧组织变褐、逐渐龟裂，叶柄扭曲以至劈裂。扩展程序是：由幼叶边缘向内逐渐褐变，最后心叶坏死。
2、形成条件和 因素。一是由于土壤中缺硼所致，二是土壤中其他营养物质元素偏多，而控制了对硼的正常汲取。其它在高温干旱的条件下也易出现缺硼症。
3、防治和治疗措施。如果土壤中缺硼，每亩可施用硼砂1kg，以补充硼元素的不足；发现缺硼症状后，可用0.1%～0.3%硼砂水溶液进行叶面喷雾。
