花椰菜较耐低温，适宜的贮藏温度为0-1摄氏度，相对湿度以95%左右为宜，如湿度偏低或通风量过大，花球失水萎蔫、松散，品质变差。在低氧（2%以下）、高二氧化碳（5%以上）环境中导致生理失调，花球产生犹如煮后的症状，并形成异味而失去食用价值。机械损害也会加快衰老变质。
品系选择、种植要求及采收
用于贮藏的花椰菜宜选择花球紧实、品质好、耐热或抗寒、适应性强的中、晚熟品系。春天可选用福农10号、瑞士雪球，秋天可选荷兰雪球等。
种植中在增加水肥管理的同时，尤须小心磷钾肥的合理施用，这不仅能促使花球良好发育，还可避免因缺钾肥而出现黑心征象。花椰菜对硼等元素也很敏感，缺硼会引起花球开裂，严重时变褐色，形成苦味。缺硼的土壤要小心硼肥的施用。
采前办法：花球刚露出时，将花球周围的叶子拢起，用草绳等轻轻捆扎，或者将花球附近的1-2片叶折断，覆盖在花球上，以坚持花球的洁白柔嫩。采前4-5天停止灌水。
采收标准：花球裸露，含水量较高，质地脆嫩时即可采收。采收时.要注意操作，轻摘轻放，选择充分长大，表面圆正，边缘花蕾未散开的花球，一般在下午4：00-5:00采收，白花球下留2-3轮叶子处割下，如用于假植贮藏，要连根带叶采收。雨天不宜采摘。
预贮对策
1.挑选整修选择直径15cm左右、结球紧实、洁白、无病虫害、无机械伤的花球，留3-5片叶，并切除下部过老的花茎。
2.防腐处理贮前可用0.15%托布津溶液浸蘸花球蒂部（不可浸入至花球）或用克霉灵保鲜剂（其重要有用成分为仲丁胺）挥发熏蒸，办法是每千克花椰菜用0.lmg克霉灵保鲜剂浸沾在吸水性好的纸或棉布条上，匀称地挂在菜垛四周或垛与垛之间，熏24小时即能控制菜体表面的病原菌。对窖、库体以及包装物件、架材等用0.5%的漂白粉液喷洒或用克霉灵保鲜剂在密封条件下熏蒸消毒灭菌。
3.预冷可采取自然气温下预冷，将待贮产品准时置于阴凉通风处，白天遮荫、夜间敞开。如有冷库可先将库温渐降至4-5摄氏度，启用通风设施迅速下降菜体温度。此法快而稳定，成效尤佳。
贮藏办法
1.假植贮藏冬天不十分寒冷的地区，可应用阳畦、简易贮藏沟假植贮藏。立冬前后将尚未长成的小花球连根带叶挖起，假植在阳畦或贮藏沟中，行距25cm，根部用土填实，再把植株的叶子拢起捆扎好，护住花球。假植后立刻灌水，恰当覆盖防寒，晌午温度较高时恰当放风。进入寒冬天节，加盖防寒物，并视需要灌水。假植区域内的小气候温度前期可高些，以促使花球成长成熟。至春节时，花球一般可长至0.5千克。该法经济简便，是民间普遍采用的贮藏方式。
2.菜窖贮藏经预处理后的花椰菜装筐至八成满，入窖码垛贮藏，垛的高度随窖高度而定，一般4-5个筐高，须错开码放。垛间坚持一定距离，并布列有序，以便于操作管理和通风散热。为避免失水，垛上覆盖塑料薄膜，但不密封。每天轮番揭开一侧通风，调节温、湿度。贮藏时期须经常检查，发现覆盖膜上附着凝聚水要准时擦去，有黄、烂叶片随即摘除。利用该法贮期不宜过长，20-30天为好。可用于临时吞吐周转性短期贮藏。
3.冷库贮藏
（1）自发气调贮藏在冷库中搭建长4.0-4.5cm、宽1.5m、高2.0m左右的菜架，上下分隔成4-5层，架底部铺设一层聚乙烯塑料薄膜作为帐底。将待贮花球码放于菜架上，最后用厚0.023mm聚乙烯薄膜制成大帐罩在菜架外并与帐底部密封。花椰菜自身的呼吸作用，可自发调节帐内的氧与二氧化碳的比例，但须堤防氧不可低于2%，二氧化碳不能高于5%。抑制办法：经过启开大帐上特制的“袖口”通风（简称透帐）。贮藏最初几天呼吸强度较大，须每天或隔天透帐通风，随着呼吸强度的减弱，并日趋稳定，可2-3天透帐通风1次。贮藏时期15-20天检查1次，发现有病变的个体应准时处理。为避免二氧化碳损害，在帐底部撒些消石灰。在菜架中、上层的周边放置部分高锰酸钾载体（用高锰酸钾浸泡的砖块或泡沫塑料等）吸取乙烯，贮藏量与载体之比是20∶1。大帐罩后也可不密封，与外界坚持经常性的微量通风，增加观察，8-10天检查1次。以上办法可贮藏50-60天，商品率达80%以上。
（2）单花套袋贮藏用0.015mm厚的聚乙烯薄膜制生长、宽分别为40、30cm（或按照花球大小而定）的袋子。将备贮的花球单个装入袋中，折叠袋口，再装筐码垛或直接码放在菜架上贮藏。码放时花球朝下，以免凝聚水落在花球上。此类办法能更好地坚持花球洁白鲜嫩，贮期达3个月左右，商品率约为90%。此法贮藏成效显著优于另外贮藏方式，在有冷库地区可推广利用。利用此法须小心的是花椰菜叶子贮至两个月之后开始脱落或腐烂，如需贮藏2个月以上，除去叶子后贮藏为好。
