紫菜薹的耐热性比菜心要差，而其成长量要大，生育期要长。高温季节易引发病毒病，水分多又易导致软腐病和霜霉病。采收菜薹后留下的伤口也易导致软腐病。因此软腐病的出现严重影响着紫菜薹的产量和质量。病毒病、软腐病、霜霉病是早熟紫菜薹的重要病害。而虫害为害较轻，只要结合治病的同时视状况恰当治虫即可。其详细的无公害防治和治疗技术参照小白菜和大白菜无公害防治和治疗。
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