菠菜易形成霜霉病和炭疽病。春、秋较多。防治和治疗要领,除留意公道密植、实验轮种、实时排水以外,在病发早期,应喷施40%乙磷铝可湿性粉剂200~300倍液,25%甲霜灵800~1000倍液防治和治疗,7~10天喷1次,连喷2~3次为好。对炭疽病可喷65%代森锌可湿性粉剂500倍液,50%多菌灵800倍液,75%百菌清600倍液防治和治疗。
菠菜还易受潜叶蝇的危害。除施充实腐熟的无机肥外,还应防止将虫源带入菠菜田。防治和治疗时,应抑制成虫产卵盛期及卵孵化始期,祛除幼虫于潜入叶肉之前。宜接纳2.5%溴氰菊酯乳油或20%氰戊菊酯乳油3000倍液防治和治疗。