芹菜的生理性障碍有烧心、空心、叶柄开裂和缺硼症。以上生理性病害严重影响芹菜的成长，下降其产量及品质。
一、烧心 1.症状：开始心叶叶脉变褐、逐渐叶缘细胞坏死，呈黑褐色。在生育初期很少产生，多在11-12片真叶时开始形成。2.形成条件和起因：烧心在高温、干旱、施肥过量的条件下容易出现。高温能加速生育速度，促使植物对氮、钾、镁等元素的过多汲取，从而影响对钙的吸取。而烧心是由缺钙导致的。在于旱条件下，由于根系对钙元素的汲取能力减弱，易导致植株缺钙，越是酸性土壤则出现越重。3.防治和治疗对策：首先要防止高温干旱，进行适温适湿管理；对酸性土壤可施用生石灰调节到中性或接近中性；施氮、钾、镁等肥料要适量。一旦出现烧心症状，可用0.5%氟化钙或硝酸钙溶液向叶面喷雾。
二、空心 1.症状：空心是一种生理老化征象，出现的位置是叶柄，是叶柄髓位置和输导组织细胞老化，细胞液胶质化失去活力和细胞膜产生孔隙。多从叶柄基部向上延伸，在同一植株上外叶先于内叶，由叶基到第1节间产生较早。叶柄空心位置呈白色絮状，木栓化组织增长。2.形成条件和起因：空心在沙性大的土壤中形成较多、进度也快，肥分不足或后期脱肥时也有出现，产品过熟或久藏失水、过多喷施赤霉素等，土壤干旱或温度太高、太低、芹菜受冻也易出现。3.防治和治疗措施：应防止在沙性过大的土壤上种植，除施足基肥外，在成长发育过程中要准时追肥，如发现叶子颜色转浓发生脱肥征象时，可用0.1%尿素液肥进行根外追肥。
三、叶柄开裂 1.症状：多数体现为茎基部连同叶柄同时开裂，不仅影响商品品质，而且病菌极易感染，致使芹菜发病霉烂。2.形成条件和起因：多在低温、干旱条伺：下，由于生育受到严重控制所致。其它，在突发性高温、多湿的条件下，由于植株吸水能力过强，组织充水时也能出现。3.预防办法：进行正常的适温、适湿管理，特别在温室内生产芹菜时，要增加保温对策；深耕土壤，多施有机肥，促使根系正常成长发育，增强其抗旱及抗低温能力。
四、缺硼症 1.症状：其体现为叶柄异常肥大、短缩，并向内侧变曲，弯曲个别的内侧组织变褐、逐渐龟裂，叶柄扭曲以致劈裂。扩展程序是：由幼叶边缘向内逐渐褐变，最后心叶坏死。2.形成条件和起因：一是由于土壤中缺硼所致，二是土壤中其他养份元素偏多，而控制了对硼的正常吸取。其它，在高温干旱的条件下也易出现缺硼症。3.防治和治疗措施：如果土壤中缺硼，每亩可施用硼砂1千克，以补充硼元素的不足；成长期发现缺硼症状后，可用0.1%-0.3%硼砂水溶液进行叶面喷雾。
