嫁接抗病重要是依靠砧木的抗病性，按照国内外人士多年研究及使用结果，现在生产中广泛利用的优异砧木重要有日本赤茄、CRP和托鲁巴姆。
(1)日本赤茄。又名平茄、红茄，是外国利用比较早的砧木品系。日本赤茄做砧木的优异特点是高抗枯萎病，中抗黄萎病，根系发达，植株的茎较粗壮。节间较短，茎和叶面上有刺，刺比较多个别。种子白色，形似辣椒籽，粗肾形，长4mm，宽3mm。很易发芽，浸种24h后，2d发芽率为23％，3d发芽率为28％，4d发芽率达93％。新苗成长速度和一般茄子一样。日本赤茄做砧木时需比接穗早播7d，嫁接办法可采用劈接法或斜接法。由于赤茄抗病性范围较窄，在黄萎病重的地块不适宜用做砧木。
(2)CRP。CRP也是一种野生茄子，是按照产地而命名的品系。该品类的茎、叶刺较多，故也称刺茄。为茄子嫁接最新的优异砧木品系。CRP高抗茄子黄萎病，现在是我国北方普遍推广利用的优异砧木品系。
CRP种子千粒重2g，棕褐色近圆形，直径3mm左右，种子发芽率7.4％，6d发芽率65.6％，8d发芽率93.44％。
CRP苗期抗猝倒病，而易侵害立枯病，较耐低温，适宜秋冬呵护地种植茄子做砧木。
(3)托鲁巴姆。托鲁巴姆品系来源于日本，此品系高抗或免疫黄萎病、枯萎病、青枯病及根结线虫病等土传病害，被称为“四抗”茄子砧木品类。它根系发达，地上植株长势极强，节间较长，茎和叶上刺少，种子很小，千粒重约1g。在一般状况下，种子不易发芽，需催芽。
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