冬种甜玉米的虫害重要有地老虎、台湾螟、玉米蚜和大螟，病害重要有大斑病、小斑病和纹枯病，详细防治和治疗措施如下：
地老虎是冬种甜玉米苗期害虫，重要有大地老虎，小地老虎、黄地老虎。这类害虫危害甜玉米小叶或嫩叶，甚至咬断小苗基部幼茎，酿成缺苗断垄，严重影响全苗。防治和治疗方法：一是人工捕捉。于清晨在甜玉米断苗的周围或沿着残留在洞口的被害株，将土扒开捕捉幼虫。二是毒饵诱杀。亩用90％敌百虫晶体50克，温水溶解成250毫升药液，与炒香的花生麸拌匀称，傍晚撒于玉米周围。
为害甜玉米的螟虫以大螟、台湾螟为聿。幼虫蛀贲心叶，影响光合作用，阻碍成长，蛀食茎杆，易风折；蛀食雌雄穗，下降受粉率，还直接蛀食籽粒。防治和治疗方法：在大喇叭日期施药。药剂可选用3％米乐尔颗粒剂 (亩用1千克)或98％巴丹可湿性粉剂(亩用50克)或90％敌百虫晶体(亩用150克，用温水溶解稀释)混细沙点心叶撒施。
玉米蚜重要在冬种甜玉米的抽雄期形成，重要危害雄花，影响授粉。蚜虫个体小，繁育快，因而不能麻痹。防治和治疗办法：可用吡虫啉2500倍液或敌蚜螟1500倍液喷雾。
大斑病、小斑病是冬种甜玉米普遍形成的两种病害。产生严重时能使叶子枯死，酿成减产。重要危害叶子，也可感染叶梢和苞叶。两种病害在孕穗、抽穗期易流行，低洼地，过于密植荫蔽地、连座地、常常发病重。防治和治疗方法：摘除植株下部黄叶、发病叶片，减少再次侵害的菌源，以利通风透光。喷洒杀菌剂，药剂可选用25％必扑尔乳油2500倍液或50％多菌灵乳油500倍液或 65％代森锌可湿性粉剂1000倍液。
纹枯病是冬种甜玉米较严重的一种病害。最初在地表的1—2节叶梢发病，重要危害乳熟期的苞叶、果穗、籽粒。土壤粘重、偏施氮肥、地势低洼及植株郁闭、不通风，透光差的地块都有利发病。防治和治疗办法：一是革新种植管理技术。小心清沟排水，施用腐熟有机肥。氮肥施用宜早不宜迟，宜少不宜多，恰当增施钾肥，提升植株抗病力。二是药剂防治和治疗。可选用25％必扑尔乳油 3000倍液或70％甲基托布津可湿性粉剂600倍液或 40％科达宁悬浮剂500倍液喷雾。
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