芒果单胚品类的一个种子只萌生一株苗，多胚品系能萌发长成多株苗。单胚种子只有一个胚（有性胚），胚大，发育成的单一苗茁壮；多胚种子有多个胚，胚较小，发育成的多株苗较弱。故过去强调采用单胚品系作砧木。但砧木的一致性对提升芒果产量和品质是很关键的，单胚苗是有性苗，成长体现差异很强，果园内差别植株成长和产量的巨大差异很可能因砧木而导致。因此，应通过试验后选用多胚品类的种子培育砧木苗。过去多推荐用果较小、果肉少、品质较差但胚充实饱满的土芒作砧木，这些土芒多为单胚，成长茁壮，由于上述 因素作砧木并不梦想。至于适合作砧木的多胚品系尚需经过嫁接亲和力、适应性和优质丰产性等试验来肯定。
实生苗重要用作砧木或育种试验。培育实生苗所用的种子应来自同一品类，采自成熟的果实，种子要饱满、无病、无虫。要尽可能快地取出播种，因为芒果种胚对失水敏感，一经干燥，发芽力快速下降。种子要剥去纤维质的皮和膜质层，用０．１％高锰酸钾液浸１分钟，取出晾干即可播种。播种基质最好用中粗河沙或蛭石，沙床厚度３０厘米。
如果是已用过的苗床，则要用１％福尔马林水溶液喷洒透，用塑料薄膜覆盖２４小时杀菌，再晾２４小时散尽气味。种胚也可在暗处保湿使胚芽萌动后再播下。播时种胚平放，单胚则使胚芽朝同一个偏向，慎密布列，行距１５厘米。播后覆盖一层２厘米厚的河沙或蛭石。如不盖塑膜保湿，气温高、空气湿度低时，必需每日淋水。如盖膜遮荫保湿，可３－５天淋水一次，以不干燥为度。在广州，６－１０月间播种，１５－２０天幼芽便可出土，一般在具３－５片红叶时移栽于育苗地。多胚种子每个可分出３－４株苗，大新苗应稍加分级，并剔除弱苗。单胚种子苗移植时间可稍迟。
为培育优质苗木，最好采用长度３０－４０厘米以上、装土３千克以上的育苗袋培育砧木苗供嫁接。因为芒果须根少，袋装育苗有利于移栽成活。在苗圃地育苗的，要选较粘质土，以便起苗时容易带上泥团。在移栽时须剪去一些主根，留下１０厘米左右，或把主根盘绕起来，以促侧根形成。育苗袋的土质可稍砂，但因施肥不如地里方便，故应混入足量的腐熟有机肥，以保证根系良好发育。移苗后要继续遮荫至叶子完全转录，枝条老熟后再给予全光照。单胚种子也可直接播于育苗袋内。
