芥菜的重要虫害有黄条跳甲、蚜虫、菜螟等。
1、黄条跳甲：俗称地蹦子、菜跳蚤，幼虫俗称白蛆。成虫、幼虫都可为害，以成虫在幼芽期危害最重，常咬坏刚出土小苗的成长点，酿成严重缺苗，甚至毁种。幼虫危害根部，虫量大时，也可酿成地下部腐烂、地上部萎蔫。
重要防治和治疗措施有：清除田间及周围杂草；被为害植株根部及周围洒石灰或淋石灰水或施氨水（切忌氨水量大酿成肥害），既有肥效，又可杀虫；药剂防治和治疗：可用晶体敌百虫喷于根周，杀虫成效良好；或用敌敌畏喷面都有较好成效。在采收前7～10天停止应用农药。
2、蚜虫：最有利于菜蚜病害产生的是16- 25摄氏度 温度下的清凉干爽天气。蚜虫繁育速率很高，每年可形成40余代，条件适宜4-5d便完成一个世代。菜农如疏忽大意或者未准时防范，则菜蚜容易传播病毒病而酿成芥菜减产失收。蚜虫防治和治疗的难点在于虫体小，早期不易发现，并且对不少药剂都发生了抗药性。选用药剂和喷洒不妥都难以达到好的成效。
重要防治和治疗办法有：如蚜虱绝（25%乳油）、吡虫啉（10%可湿性粉）、蓟蚜净（15%乳油）、莫比朗（3%乳油）、克蚜宝（19%乳油）等。
3、菜螟：又名菜心野螟、钻心虫、剜心虫。幼虫是钻蛀性害虫，为害蔬菜小苗期心叶及叶子，受害苗因成长被破损而停止成长或萎蔫死亡，酿成缺苗断垄。翌春越冬幼虫入土6- 10cm 做茧化蛹。成虫卵多散产于菜苗嫩叶上。初孵幼虫潜叶为害。此虫喜高温低湿环境。
重要防治和治疗办法有：（1）农业防治和治疗：一是耕翻土地，减少虫源；二是调解播种期，使菜苗3-5片真叶期与菜螟盛发期错开；三是恰当灌水，既可控制害虫，又能促使菜苗成长。（2）药剂防治和治疗：成虫盛发期和幼虫孵化期，用1.8%害极灭乳油、5%菜喜悬浮剂喷雾。
