秋茬哈密瓜种植在7月下旬到8月上旬为最佳播种时间。
秋茬育苗，一般只进行晒种和浸种两步处理。也可采用烘干机70℃干热处理24小时后，直接干籽播种。详细操作办法是：将哈密瓜种子用纸或者信封包起来，然后放入烘干机内，调解烘干机温度到70℃，等待温度上升到设定温度后，坚持设定温度24小时，即可杀灭枯萎病、蔓枯病等种子携带病菌。干热处理的种子能够直接进行播种。
秋茬哈密瓜苗期从七月下旬到八月中旬左右，需要15天左右的时间。
秋茬育苗时的首要问题是高温， 播种完成后，要用遮阳网覆盖苗床，避免日光直射，起到下降温度的作用。育苗棚内的温度可经过改善棚室的通风条件来抑制管理；晌午温度太高时，采用遮阳网进行遮阳降温。但遮阳网只可在光照非常强的时候短时间应用，遮阳时间过长则易酿成秧苗疯长。一般保证白天温度不要超过35摄氏度。秧苗拱土后常有种壳不易脱落的“带帽”种苗，带帽苗会影响子叶伸展，阻碍新苗的发育。可在早晨准时进行人工摘除，堤防摘除时不要伤及子叶。
哈密瓜苗期易得的病害重要是猝倒病，猝倒病的产生时而引起幼苗死亡，影响成苗率。所以，防治和治疗猝倒病应该在发病初期准时用75%百菌清可湿性粉剂500倍液，或70%代森锰锌可湿性粉剂500倍液进行药剂喷洒。以抑制病情加重。
