嫁接的成活率受砧木与接穗的亲合力、嫁接技术、嫁接后的管理等要素的影响。而砧木与接穗的亲合力高低是最基本的要素。它不仅影响嫁接的成活率，还会进一步影响黄瓜的产量和品质。所以要特别小心砧木与接穗的正确选择。
嫁接的砧木应具备与黄瓜亲合力强，成长旺盛，成长期长，耐低温、高温、和贫瘠能力强，根系汲取能力强，耐湿、耐旱，抗黄瓜的重要病害，特别是枯萎病等土传病害。秋、冬、春嫁接种植宜选择耐低柔和高温的品系作砧木，以适于秋、冬、春天种植的黄瓜品系作接穗；而夏天宜选用耐高温的黄瓜品系作接穗。我国目前冬、春天种植黄瓜嫁接砧木重要用美国黑籽南瓜、南砧1号（即云南黑籽南瓜）、汲87-1、汲87-2等，其中用最普遍的是云南黑籽南瓜。夏秋天种植用的砧木除抗病外，还要耐热，砧木可选用日本的金刚、刚力、改良新土佐1号、云龙1号等。
嫁接后接穗的成长习性、抗逆性、抗病性、商品性等仍以原有特点为主体现出来。所以接穗（黄瓜）品系的选择要按照种植的季节和当地的消费习惯，选择抗逆和抗病性强、丰产、优质，与砧木亲合力强的品系。特别要小心不是全部的黄瓜品系都能与上述的砧木嫁接生产的，如用耐低温的云南黑籽南瓜与耐高温的夏丰黄瓜品类嫁接，一般成活率较低。冬茬阳光温室黄瓜接穗宜选用耐低温、耐弱光，植株长势旺，不易疯长，雌花节位低，节成性好，抗病，品质好的密刺类型。
