菜农多在丝瓜结瓜后期自己留取丝瓜种。一般来说，留种后的植株不再进行丝瓜的正常生产。但是，从丝瓜坐瓜到种子成熟需80~90天，在这近3个月的时间里仅仅只培育种子势必会影响丝瓜生产的效益。若在丝瓜后期巧管理，就能够保证丝瓜留种、结瓜两不误。
在丝瓜进入计划留种期时，在计划留种的瓜条的下方1~2节处，提前保留一条侧蔓，主蔓摘心后，使该侧蔓代替主蔓继续结瓜。
主蔓留种的瓜条的上方至少要保留5~6片叶，以保证种子发育所需要的养份。
侧蔓要准时吊蔓，且在主蔓留种瓜后15天不宜留瓜，以避免争夺养份影响种子的正常发育。因为15天左右丝瓜瓜条膨大基本结束，进入种子成熟期，所以为防止种瓜过小或瓜条膨大慢，不宜在侧蔓上留瓜。同时，侧蔓叶子制造的营养物质也可大量供应种瓜的成长，便于提升所培育的种子的数量和质量。
侧蔓结瓜前期，点花时点花药浓度要小。配方：在2千克水中加入10毫升靓果素、6毫升2，4～D、10毫升萘乙酸、10毫升花蕾保、12毫升丝瓜保花素、20毫升绿之源、1克腐烂灵，座果灵能够先不加，以减少营养物质的争夺，防止激素中毒，酿成植株早衰。通过80~90天，种瓜采收后，可恰当增大点花药的浓度，可将2，4～D加至8毫升，并再加入10毫升座果灵。
虽然丝瓜根系发达，但进入留种期后，丝瓜已进入了生产后期，植株不可防止地存在着衰退征象，所以为保证留种和结瓜两不误，必需要加大肥料的用量。追肥可经过冲施和叶面喷施来完成。可配合冲施生物菌肥和高钾化肥，以达到促根养棵、保花保果的目的。生物菌肥每亩每次冲施20~25kg；高钾化肥每亩每次冲施15~20kg。也可冲施硫酸钾复合肥，每亩每次冲施25~30kg。叶面喷肥重要是为了补充根际追肥的不足，以满意丝瓜留种和结瓜对养份的大量需求，可喷施全养分型叶面肥。
