玉米是天然异花授粉作物，加之生产条件和过程比较复杂，种子形成机械混同和天然混同的机会较多。实践证明，除了仔细贯彻安全可依靠隔离，规格无误播种，严格去杂去劣，准时彻底去雄，分收单放穗选五项技术外，还必需搞好原种繁殖工作，对已经混同的自交系进行提纯复壮，用优质原种有计划地定期替换生产上的自交系种子，这是保证杂交种子质量的一项根本方法。
下面介绍自交系的提纯复壮办法。
一、隔离穗行法（又称穗系选种法此法适用于纯度较高的自交系。秋天从繁育地里选收典型性强、结实饱满、无病虫害的优异果穗，来年春季选好隔离地块，每穗种一垄，出苗后严格去杂。抽雄前把混同或可疑穗行的雄穗所有拔掉，典型穗行里的杂株也要严格去雄舍弃，秋收时从选留下来的最典型穗行里，再选长相一致、穗型相似的典型果穗，留作下一年穗系选种用的种穗。从其余选留的典型穗行里舍弃混同的可疑果穗，然后混在一起脱粒，供下年大量繁育或杂交配种用。
穗系选择过程最好针对幼芽色、抽雄期、花丝色、株高、整齐度、成熟期和病虫害状况逐行记载，作为秋收时选留或舍弃的依据。
二、一穗传提纯法为了坚持原自交系的优异种性，提升现有自交系的典型性，可采用一穗传的繁育对策。鉴于目前不一样育种单位的同一个自交系的典型性、配合力等都不尽相同，最好从原育成单位直接引入一个典型穗作为一穗传原种。
第一年：在一穗传隔离繁育区里，把由育成单位引入的典型穗单粒点播，在出苗后开花前堤防去杂去劣，再选株套袋自交5穗～～10穗，秋后选出一个最好的种穗，留作第二年一穗传用种，从其余几百个果穗里，选出50个～～100个典型穗，分穗保存，作下年穗行选种用种。
第二年：继续在一穗传繁育区里，单粒点播和选株套袋自交5穗～～10穗；在穗系选种繁育区里，用第一年选留的50个～～100个典型穗分行播种，按穗系选种法的要求进行穗行繁育和选种。秋天从一穗传繁育区里选留一个最好的套袋自交典型穗和50个～～100个未套袋的典型穗，从穗系选种繁育区里选收典型穗行里的典型种穗混在一起脱粒，或按穗行脱粒，分别送给差别单位作为自交系原种繁育或配种。
第三年：按第二年做法，分别设置一穗传繁育区，穗系选种繁育区和自交系原种繁育区。分级繁育，间断选种，可使现有自交系较快地得到纯化。
