菠萝蜜的种植关键在于育苗。育苗也分为砧木苗的培育，和嫁接苗的培育两个区别的阶段。培育菠萝蜜的砧木苗，必需先选种，在沙床上播种催芽。每年的6～10月都能够催芽。大规模栽培能够选在9～10月份进行。
催芽前的第一件事情当然是选种了。种子最好选择抗逆性和适应性强的本地菠萝蜜品系的种子。要选用从果实中剥离出来的新鲜种子，时间不能超过48小时。要求种粒成熟、饱满、外面光滑、无斑点。没有外伤，没有病虫的为害。用这样健康的种子，能够保证出芽率。选种完成后，再进行种子处理。
种子处理的第一步是洗种。选出的种子应该立刻放入清水中，用手搓洗最好搓洗2－3分钟。要洗干净。像这样搓洗两遍，将果粒上的果肉和糖分搓洗干净。清洗干净了种子再播种，就不会引来蚂蚁的侵染，也不会有其他病虫害的产生。
洗种之后，要对种子做消毒处理。消鸩杀菌药物选用多菌灵500－800倍液加新高脂膜800倍液，在配好的药液中加入15公斤清水，将种子倒入药液中，让种子浸泡2－3分钟。接下来做沙床催芽的预备工作。
沙床面积能够按照种子的多少而定。要选用细河沙做芽床，湿度要求为25%。用手握捏不粘手，还能立刻地散开，这样的河沙才能算合格。先铺10－15厘米厚的沙土作为底沙，一定要铺平整，用薄木板刮平整就最好了。为了便于管理，一般做成10米长，1米宽的床面。
铺好了底沙，将处理好的种子慢慢地铺呈在沙床上，要让种子散开，以免妨碍出芽。铺完了种子，我们在种子上覆盖一层面沙。厚度在2厘米左右就能够了。接下来，我们要在芽床上铺盖一层干枝杂草，以达到进一步遮阴保湿的目的，还有增温的成效。
如果在18－30摄氏度之间，催芽20天左右就能够了。如果遇到8－18摄氏度的天气，催芽大概需要35天左右才行。要观察沙床的干湿情况，要准时淋水。淋水的次数不定，以坚持土面的湿润为原则。等到出芽之后，揭开杂草。这时我们会看到新苗已经长到3－5厘米这么高了。
