个别树木和花卉扦插生根比较困难，甚至插穗的愈伤组织已出现疙瘩，还是生不出根来。按照插穗的详细状况，分别采取以下相应办法，可收到比较好的成效：
一、清水处理
清水处理的目的是减少或消除插穗体内阻碍生根的物质。将插穗绑成小捆，下端浸在水中，每日换水一次，在遮阴保湿条件下培养7至10天，再通过生根素处理后扦插。
二、扦插期间
树种或品系的遗传性有不一样，其体内的营养物质物质、生根诱导物质和阻碍生根物质的多少，直接影响插穗生根的难易和快慢。不一样季节，插穗体内各种物质的含量和相互作用同样影响插穗的生根质量。因此，扦插时.要仔细了解插穗品系的生根习性，准确把握差别树种或品系扦插适宜期间，如白花木槿、丁香、松柏、杉木等重要在春天扦插；山茶、桂花、黄杨、叶片花、樱花等夏天扦插成活率高；优异品类月季、梅花、木芙蓉、桉树、油橄榄等秋天扦插成效好；北方地区在温室或棚室内冬天扦插，以苗繁苗很容易生根。
三、消毒灭菌
嫩枝扦插育苗是靠叶的光合作用，将空气中的二氧化碳转化成碳水化合物，并合成天然的生根激素等有利于生根的物质，这是插穗生根的关键要素。只要保证插穗不腐烂变质，使插穗坚持正常的生理运动和发挥自身的生理作用，就一定会生根成活，产生新的个体。同时，但凡生根困难的树种和花卉生根时间很长，一般都在20天之后才形成不定根，有的品系需要40天或更长的时间。在漫长的高湿环境下很容易出现腐烂病，所以务必高度看重，在扦插前后对插穗和周围环境进行严格灭菌处理，并在生根过程中每周按时喷药。常用的杀菌剂有百菌清、多菌灵或退菌特等。
