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温室黄瓜在种植管理过程中时而形成弱棵，畸形瓜，褐斑病，甚至死秧，这些都直接或间接地与根系弱有关。所以，在管理中应采取对策培育发达根系，以达到抗病、增产的目的。
第一，订植前深翻土壤，并施腐熟的有机肥，为根系成长创造良好的土壤环境。深翻土壤25厘米以上，能为黄瓜的成长供给良好的土壤通透条件和养分供应。
第二，订植时可穴施生物菌肥，以菌抑菌，增强黄瓜根部的抗病能力。生物菌肥还有刺激生根的作用，可在黄瓜订植时穴施生物菌肥，以防病促根防死棵。
第三，墩苗后准时中耕锄划，促根下扎。缓苗后准时墩苗，以达到壮苗促棵的目的。墩苗过程中，要中耕锄划2～3次，以改善土壤通透性， 保证土壤商情，引根下扎，培育发达的根系。
第四，黄瓜进入结瓜期，在根系、座果都不佳的状况下，应做到先养根后促果。一是根部灌施生根剂，叶面喷施叶面肥、细胞分裂素;二是应用高氮高钾的冲施肥，这样既可满意黄瓜瓜条成长所需的营养物质，又可促根壮秧。三是小心和谐好结瓜和壮棵的关系。结瓜期准时疏瓜，不要养大瓜、老瓜，尽量不要过量利用激素处理瓜及瓜秧，避免根系早衰，秧苗老化。
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