1、穴盘选择:育2叶1心苗用288孔穴盘，4～5叶苗用128孔穴盘，5～6叶苗用72孔穴盘。
2、基质准备：基质的配比是蛭石草炭：鸡粪：牛粪为2：1：1：1或1：1：0.5：0.5，再加少量缓释肥料，草炭需经粉碎过筛后使用。或选用草炭与蛭石2︰1，再加少量缓释肥料，草炭需经粉碎过筛后使用。将配好的基质装入穴盘摆好待用，基质不可装得过满，以防浇水时水流出。或草炭与蛭石加废菇料1︰1︰1， 覆盖料一律用蛭石。
3、选穴：将有机茄子种子放入50℃～55℃温水中，搅拌至室温浸泡20小时，捞出种子用清水冲洗干净，滤去水分，“出水”后备用。播种前把穴盘浇透，以穴盘底孔有水渗出为准，将种子放入穴盘，每穴1～2粒，再盖上一层基质，与盘面相平，覆上地膜，保温保湿。
4、育苗：有机茄子出苗期间保持25℃～30℃。当出苗达到五成以上时揭开地膜，以后温度应掌握在22℃～25℃。穴盘育苗要注意及时补水，一般基质表面发白时就需要补水。
5、补苗、分苗：有机茄子一般出苗率只有60%～70%。为此，对一次成苗的，需在第一片真叶展开时，将缺苗孔补齐。考虑茄子补苗的工作量，所以在用72孔穴盘育茄苗时，大多是先播种在288孔苗盘内，当小苗长至1～2片真叶时，再移至72孔苗盘内。
6、定植：当苗子5～7片真叶、株高15厘米左右、根系成佗并喷出白根时即可定植。定植时直接将苗盘运至大田，将苗子带佗用手拔出，植入田中即可。
