秋冬茬西芹使用棚室、温室等设施种植，因呵护地内温度高、湿度大，易出现病害。现将常见的4种病害的防治和治疗对策简要介绍如下。
软腐病重要形成于叶柄基部和茎上。先产生水浸状、淡褐色纺锤形或不规则形凹陷斑，然后呈湿腐状，变黑发臭，只残留表皮。病菌在土壤中越冬，从伤口侵入，借雨水或灌溉水传播蔓延。湿度大时发病重，有时和冻害或其他病害混发。防治和治疗办法：实行3年以上轮做；移栽、松土时防止伤根；雨后准时排水；发现病株准时挖除，并撒石灰消毒，减少浇水或暂停浇水；发病初期用72%农用硫酸链霉素可湿性粉剂3000倍液喷雾防治和治疗。
斑枯病重要为害叶子。发病初期病斑呈圆形或不规则形，边缘显著，黄褐色，中间灰白色，上散生黑色小点。冷凉、高湿、多雨或植株衰弱时发病重。防治和治疗方法：增加田间管理，增强植株抗病能力；降温排湿，缩小昼夜温差，减少结露，不要大水漫灌，可膜下暗灌；发病初期能够喷施5%百菌清粉尘剂，每次每亩用药1千克，也能够喷施75%百菌清可湿性粉剂600倍液或加瑞农47%春雷·王铜可湿性粉剂500倍液防治和治疗。
菌核病重要为害茎、叶。病部初呈褐色水浸状，湿度大时产生软腐，表面生出白色菌丝，后产生鼠粪状菌核。气温15摄氏度、相对湿度85%以上时易发病和流行。防治和治疗方法：与其他作物实行3年轮种；发病初期能够喷施50%腐霉利可湿性粉剂或50%异菌脲可湿性粉剂或70%甲基硫菌灵可湿性粉剂600倍液防治和治疗，也能够喷施5%百菌清粉尘剂，每次每亩用药1千克。
病毒病全株都会受害，形成叶子皱缩、花叶等症状。病毒在田间重要经过蚜虫传播，也能够经过操作接触传毒。种植管理条件差、干旱，蚜虫数量多，发病重。防治和治疗办法：防治和治疗蚜虫；增加肥水管理，促使植株成长健壮，提升抗病能力；发病初期喷施植病灵1.5％烷醇·硫酸铜水乳剂1000倍液或病毒A20%吗胍·乙酸铜可湿性粉剂500倍液防治和治疗。
