黑豆种子干燥贮藏法
在常温下，黑豆的安全贮藏水分为11%-13%，临界水分为1.4%。贮藏的黑豆收获期多在中秋以后，收获后干燥降水的方法有日光曝晒和设备烘干等。只要气候条件允许，日晒法简单易行，经济实用 ，但劳动强度大，卫生条件差，适合于小厂使用。
黑豆种子通风贮藏
通风贮藏是指黑豆在贮藏过程中，要保持良好的通风状态，使干燥的低温空气不断地穿过黑豆籽粒间，以降低温度，减少水分，防止局部发热、霉变。
黑豆种子低温贮藏
低温的好处是能够有效地防止微生物和害虫的侵蚀，使种子能处于休眠状态，降低呼吸作用。根据试验，温度在10℃以下，害虫及微生物基本停止繁殖，8℃以下呈昏迷状态，当达到0℃以下时，能使害虫致死。
黑豆种子密闭贮藏
密闭贮藏的原理是通过密闭方式与外界隔绝，以减少环境温度、湿度对黑豆粒的影响，使其保持稳定的干燥和低温状态，防止虫害侵入。同时，在密闭条件下，由于缺氧，既可以抑制黑豆的呼吸，又可以抑制害虫及微生物的繁殖。
密闭贮藏法包括全仓密闭和单包装密闭两种。全仓密闭贮藏室建筑要求高，费用多。单包装密闭贮藏，可用塑料薄膜包装，此法用于小规模贮藏效果好，但也要注意水分含量不宜太高，否则也易发生变质。
黑豆种子化学贮藏法
化学贮藏法就是在黑豆贮藏以前或贮藏过程中，在黑豆中均匀地加入某种能够钝化酶、杀死害虫的药品，从而达到安全贮藏的目的。这种方法与密闭法、干燥法等配合使用，效果会更佳。
