1.冻藏法：应用逐渐下降的气温使入贮的菠菜逐渐适度冻结，并在冻结的状态下冻藏直至上市。详细做法是在风障、房屋或院墙北侧遮阴位置做与风障偏向相同的菜畦，畦深同菠菜高，将经扎捆预冷的菠菜在畦中顺向码两排，中央留约15厘米孔隙，菜捆间不要依靠的太紧，以利通风散热。然后在菠菜上覆一层细土或细砂，早先随天气渐冷，逐步培土坚持冻结状态，以不化不能深冻为度。
同时在背阴处顺向挖一条或数条冻藏沟，仅能放两排菠菜的窄沟下面可不设通风道。放8—12排菠菜的宽沟下面需挖设约20厘米深宽，两端与地表相通的通风沟，将菠菜捆根朝下排在沟内后，上面覆盖一层秸秆，以利保湿，待天气渐冷，菠菜轻度冻结后随气温逐降而分次覆盖细土或细砂，坚持沟内～2—～4摄氏度的低温。
上市前应取出菠菜放在2摄氏度左右条件下缓慢解冻，冻结状态的菠菜，在搬运过程中，应堤防防止挤压碰伤。
2.袋装自发气调冷藏法：将收获后通过整理的菠菜捆成0.5—1.0千克的菠菜把，通过散热预冷后，装入0.06—0.08毫米厚，110×80厘米规格的聚乙烯薄膜袋中，叶子相对，根朝袋两端，每袋约15—20千克，送到冷库菜架上平放，敞口再预冷一昼夜，然后用一向径约2厘米的圆棒插入袋口扎紧，再拔出圆棒，或松扎袋口，并使袋内留有较大孔隙，封袋后置入～1—1摄氏度温度，90%—95%相对湿度的冷库中，依靠袋内菠菜自发代谢运动吸氧排碳作用，可逐渐产生一个较低氧，较高二氧化碳的气体环境，同时内部湿度条件好，可保鲜2—3个月，损耗不大。
