玉米苗颜色多数为深绿色，如果管理不妥、缺肥或者气候异常，玉米苗颜色会变成黄色、红色、白色、紫色、淡绿色、黄绿色等异常的颜色，即所谓的黄叶苗、白化苗、紫叶苗、僵叶苗、黄绿苗。玉米苗颜色异常，既影响玉米正常成长，又下降产量和品质，因此，要设法抑制。
黄叶苗 起初秧苗叶色淡绿，逐渐变黄，严重时全叶枯死。其为害是酿成空秆或秃尖。出现 因素：种子不饱满，秧苗不壮；播种过深，出苗弱；密度过大，影响生育；土壤缺肥。抑制办法：一是播前精选良种，挑出秕粒、霉粒、坏粒、小粒， 保证种子净度、纯度均在98%以上，发芽率在90%以上。二是催芽播种，采用种子包衣或肥水浸种。三是适期减苗，在玉米3到4叶时去除幼苗、弱苗、病苗及田间杂草。四是剪苗后，补施氮肥，促苗早生快发。五是对出苗前后有干土块的，要准时打碎干土块。
白化苗 叶子上有白色的条纹，严重的全株叶子发白，最后干枯，酿成植株死亡，颗粒不收。出现 因素是土壤中缺锌。抑制对策：一是用锌肥作种肥，每667平方米用硫酸锌1.5～2.0公斤，和15～20公斤细土混在一起匀称，在玉米播种时撒在种子旁边。二是锌肥拌种，用2～3公斤温水，溶解1公斤锌肥，拌25公斤玉米种子，阴干后播种。三是叶喷锌肥，对产生缺锌的苗，每667平方米用0.2～0.3kg的硫酸锌加水100kg进行喷雾，每隔7天喷1次，一般喷2～3次即可使苗恢复正常。
紫叶苗 秧苗叶子、叶鞘由绿变红，最后变紫，一般在玉米3叶期发生，在4～5叶时体现最显著，根系不发达，茎细小，成长缓慢，叶子由绿变紫，严重时叶子枯死。出现紫苗重要是.因为土壤缺磷，根系汲取能力降低，叶绿素合成受阻，致使叶子由绿变紫，3叶期后低温也易形成紫苗。紫苗的为害：可引起玉米空秆、秃尖，影响产量，下降品质。抑制方法：一是增施磷肥作基肥，一般667平方米施40～50kg过磷酸钙和腐熟发酵的有机肥作基肥。二是叶面喷施磷酸二氢钾，若产生紫苗，能够用0.2％的磷酸二氢钾进行叶面喷施2～3次，时间间隔8天左右。
僵叶苗 重要出现在新苗3叶期之前，秧苗株形细小、叶子淡绿，不壮、不新鲜，黑根多，移栽后，除新叶呈绿色，外叶发黄发僵，抗逆性差，易形成死叶、死苗。引起僵叶苗的 因素是：土壤过硬、过多利用化肥、过多应用种肥、种和肥隔离不佳烧苗、土壤干旱、发育不良等起因。抑制方法：一是苗期以腐熟的有机肥为主，不用或少用尿素作基肥。二是坚持土壤恰当的温度，湿度，且壮苗移栽。三是合理灌水、锄草、防病灭虫。四是准时喷施叶面肥。
黄绿苗 玉米苗叶子细窄，株形矮小，叶子形成黄绿相间的条纹，严重时叶子呈深褐色，最后焦枯死亡。症状从下部叶子开始，逐渐向上部叶子转移。这种苗的为害是易引起玉米倒伏。抑制办法：一是增施钾肥。通常要按照土壤钾素的盈亏状况，肯定钾肥施用量，如果没钾肥可补施草木灰。二是对严重缺钾地块，应在苗3叶期用磷酸二氢钾、草木灰浸出液进行小苗喷雾。
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