嫁接育苗的关键是砧木选择。首先，砧木应具有突出的抗病或抗逆特性，能弥补种植品系的性状缺陷；其次，砧木应与接穗具有高度的嫁接亲和力，以保证嫁接后准时愈合成活；第三，砧木还应与接穗有高度的共生亲和力，以保证嫁接成活苗种植后正常成长，对果实品质等无不良影响。目前，黄瓜普遍用黑籽南瓜作砧木，西瓜瓠瓜作砧木，茄子用赤茄、托鲁巴姆等野生茄或杂交种砧木。
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